Ajuster la Transparence (alpha) de stat_smooth lignes, et pas seulement la transparence de l'Intervalle de Confiance

À l'aide de ggplot2 de stat_smooth(), je suis curieux de voir comment on peut régler la transparence de la ligne de régression. À l'aide de geom_points() ou geom_line(), normalement définit une valeur pour "alpha", en indiquant le pourcentage de transparence. Cependant, avec stat_smooth(), alpha permet de définir la transparence de l'intervalle de confiance (dans mon exemple ci-dessous, éteint - se=FALSE).

Je n'arrive pas à trouver une façon de faire de la ligne de régression(s) une baisse de transparence que 1.

Votre avis serait merveilleux.

Exemple De Code

 library(reshape2)
 df <- data.frame(x = 1:300)
 df$y1 <-  0.5*(1/df$x + 0.1*(df$x-1)/df$x + rnorm(300,0,0.015))
 df$y2 <-  0.5*(1/df$x + 0.3*(df$x-1)/df$x + rnorm(300,0,0.015))
 df$y3 <-  0.5*(1/df$x + 0.6*(df$x-1)/df$x + rnorm(300,0,0.015))
 df <- melt(df, id = 1)

 ggplot(df, aes(x=x, y=value, color=variable)) +
   geom_point(size=2) +
   stat_smooth(method = "lm", formula = y ~ 0 + I(1/x) + I((x-1)/x),
               se = FALSE,
               size = 1.5,
               alpha = 0.5)

Ajuster la Transparence (alpha) de stat_smooth lignes, et pas seulement la transparence de l'Intervalle de Confiance

InformationsquelleAutor EconomiCurtis | 2013-10-20
  1. 58

    Pour définir la valeur alpha juste pour la ligne, vous devez remplacer stat_smooth() avec geom_line() et puis à l'intérieur de la geom_line() utiliser les mêmes arguments que dans stat_smooth() et en outre ajouter stat="smooth".

    ggplot(df, aes(x=x, y=value, color=variable)) +
  geom_point(size=2) +
  geom_line(stat="smooth",method = "lm", formula = y ~ 0 + I(1/x) + I((x-1)/x),
              size = 1.5,
              linetype ="dashed",
              alpha = 0.5)

    Ajuster la Transparence (alpha) de stat_smooth lignes, et pas seulement la transparence de l'Intervalle de Confiance

    • Juste une remarque: avec cette méthode, l'intervalle de confiance a disparu. J'ai posté une autre question à ce sujet: stackoverflow.com/q/29235114/3871924
    • Elferts, connaissez-vous une meilleure solution à cette question? Tout ggplot d'agrandissement ou d'amélioration sur ce point ?
    • Note à moi-même: courant (Novembre 2018) valeur par défaut de l'alpha pour geom_smooth de remplissage est alpha = 0.4
    InformationsquelleAutor Didzis Elferts
  2. 9

    Comme une alternative qui est légèrement plus intuitive -- peut-être créé depuis cette réponse, vous pouvez l'utiliser stat_smooth (geom="line"). La SE de l'enveloppe disparaît, si vous pouvez le rajouter avec quelque chose comme:


    geom_smooth (alpha=0.3, size=0, span=0.5)
    stat_smooth (geom="line", alpha=0.3, size=3, span=0.5) +

    La première ligne crée la SE. avec n (0 largeur) de la ligne et de la deuxième ligne ajoute la ligne au-dessus de lui. L' (actuel) de la documentation mentionne que stat_smooth est pour les non-standard geoms (par exemple, "la ligne").

    • Réglage de la taille=0, ne fait plus la ligne de disparaître. Alternativement, vous pouvez utiliser le paramètre type de ligne=0 le tracé de la norme de l'erreur sans la ligne régulière.
    InformationsquelleAutor Wayne