Changement De Boîte À Moustaches Étiquettes De L'Axe Des

J'ai un bloc de données mdata qui a les colonnes variable et value que je me suis tracé sur une boîte à moustaches dans R. je suis traçage log10(valeur) sur l'axe des Y & des variables sur l'axe des abscisses. Je veux changer les étiquettes sur l'axe des Y tels qu'il montre les valeurs d'origine et de ne pas le log10(valeur). 

>mdata

   ID          variable value
  SJ5444_MAXGT   coding 17455
  SJ5426_MAXGT   coding 17961
  HR1383_MAXGT   coding 17579
  HR5522_MAXGT   coding 17797
 CH30041_MAXGT   coding 20099
  SJ5438_MAXGT   coding 17467

Je veux l'axe Y de l'intervalle de de min(mdata$valeur) à max(mdata$valeur) avec un intervalle de 10000. Mais je suis incapable de le faire.

Voici mon code:

boxplot(log10(as.numeric(value))~variable,data=mdata,yaxt="n",border="red",main="Boxplot: Seattle Seq Annotation")

axis(side=2,labels=seq(min(mdata$value),max(mdata$value),10000),cex.axis=0.65,tck=-0.02,at=seq(min(mdata$value),max(mdata$value),by=10000))

J'ai essayé de comprendre quel est le problème ici, mais ce n'est pas évident. Toute aide serait appréciée.

  • côté=2 créer l'axe des ordonnées. Et je pense qu'il serait avery mauvaise idée de convertir un ensemble de données.cadre de la matrice lorsque vous avez des colonnes de texte.
  • désolé, je voulais créer un axe Y, j'ai édité la faute de frappe.
  • Prendre la as.matrix, trop.
  • Vous avez oublié de connecter les valeurs de la at=. Pour avoir vu qui a vite été juste d'utiliser axis(2)
InformationsquelleAutor Komal Rathi | 2013-10-15
  1. 3

    Le problème semble être que votre boxplots sont basés sur log10 de value, alors que l'axe vous êtes dessin utilise les valeurs d'origine. Il y a deux façons de résoudre ce problème. Soit utiliser log10 pour générer votre axe de tiques ou d'utiliser log="y" lorsque vous générez votre boxplots pour faire la transformation de coordonnées. Voici une illustration avec des exemples de données:

    set.seed(123)
x<-sample(100,1000,T)
var<-sample(letters[1:5],1000,T)

    Choix numéro 1:

    boxplot(log10(x) ~ var,yaxt="n")
axis(side=2,labels=round(10^(seq(log10(min(x)),log10(max(x)),len=5)),2),at=seq(log10(min(x)),log10(max(x)),len=5))

    Changement De Boîte À Moustaches Étiquettes De L'Axe Des

    Choix numéro 2:

    boxplot(x ~ var,yaxt="n",log="y")
axis(side=2,labels=seq(min(x),max(x),len=5),at=seq(min(x),max(x),len=5))

    Changement De Boîte À Moustaches Étiquettes De L'Axe Des

    Vous pouvez obtenir les tiques être espacés de manière logarithmique ou linéaire avec la méthode en spécifiant le at paramètre de manière appropriée, par exemple, cette commande sera uniformément espacés les marques de graduation sur un terrain généré avec log="y":

     axis(side=2,labels=round(exp(seq(log(min(x)),log(max(x)),len=5)),2),at=exp(seq(log(min(x)),log(max(x)),len=5)))
    InformationsquelleAutor mrip
  2. 0

    Essayez ceci (besoin de plus d'une annotation, afin de diminuer l'intervalle):

    axis(side=2,labels=seq(min(mdata$value), max(mdata$value),1000),
         at=log10(seq(min(mdata$value),max(mdata$value),by=1000)))
    InformationsquelleAutor 42-