Charger la base de données MIT-BIH Arythmie ECG sur MATLAB
Je suis en train de travailler sur l'ECG de traitement du signal à l'aide de réseau de neurones qui implique la reconnaissance de formes.
Comme j'ai besoin de collecter toutes les données à partir de Matlab pour l'utiliser comme signal de test, je trouve qu'il est difficile de les charger dans le logiciel Matlab.
Je suis de l'utilisation des MIT Arythmie base de données ici.
Le signal doit être indexés et stockés en tant que structure de données dans Matlab format compatible.
Actuellement, le signal est en .atr
et .dat
format.
Comment pouvez-vous vous charger d'Arythmie MIT-BIH base de données sur Matlab?
source d'informationauteur L.fole
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Vous pouvez utiliser physionet ATM pour obtenir .tapis de fichiers qui sont plus faciles à travailler avec.
Dans le entrée partie de sélectionner la conduit, la longueur, la base de données et de l'échantillon.
Dans le boîte à outils sélectionnez
export as .mat
:Puis télécharger le".tapis de fichier,
Pour ouvrir le fichier dans MATLAB, voici un exemple de code:
et vous obtiendrez,
Toutefois, Si vous le lisez annotation fichiers pour arythmie ou complexes QRS ce serait un autre problème.
Modifier
La base et gain viennent de la info fichier (deuxième image).
Ce fichier vous donne diverses informations concernant le signal ECG.
Dans la dernière phrase, il dit: Pour convertir à partir des matières premières unités les unités physiques présentées ci-dessus, soustraire 'de base' et divisez-le par "gain".
Vous avez besoin du programme
rddata.m
(script MATLab) de ce site internet. Le programme peut être trouvé ici.rddata.m
est probablement le seul programme que vous aurez besoin de lire les signaux ecg. Je me souviens d'avoir utilisé ce programme et de la base de données me suis pas trop longtemps.J'ai donc lu cette réponse il y a 3 mois et supprimé de la base et du gain. Il s'avère , j'ai complètement changé ma R-pics dans différentes directions, de la défonce de toutes mes résultats. Alors que je ne suis pas sûr si cela est nécessaire dans matlab ou pas, NE le faites PAS si vous n'êtes pas de prétraitement du signal sous matlab. J'ai été prétraitement mon signal en python, et j'ai tout de normalizae il a été
et utilisé de butterworth filtres pour supprimer les artefacts (0,5 hz-45hz)
CORRECTION
La coupure que j'ai sélectionné est 0,5 à 45 pas 5-15 comme je l'ai indiqué précédemment. Cette coupure préserve le QRS pour diverses arythmies sans ajouter trop de bruit
Il y a un tutoriel pour l'utilisation de matlab pour lire les données. tutoriel pour matlab utilisateur
installer "La WFDB Toolbox pour Matlab" à partir du lien ci-dessus. Ajouter le dossier de la boîte à outils pour le chemin d'accès dans matlab.
Télécharger le signal ECG. Assurez-vous de télécharger
'.atr', '.dat' and '.hea'
ensemble pour le signal vous sont traiter avec.De commande de matlab est comme suit :
[tm,signal,Fs]=rdsamp( filename , 1 ) ;
[ann,type]=rdann( filename , 'atr' ) ;
Remarque: pour le signal '101', son nom est '101'. Et vous pouvez consulter le détail des informations sur rdsamp et rdann du tutoriel.
viens de l'utiliser
Utilisation ATM pour extraire .tapis de comme décrit par Kamtal (maintenant connu Rashid).
Toutefois, notez que pour voir la .info fichier dans certains cas, vous devez cliquer sur la flèche
Après que j'ai poussé en avant pour les développeurs icinous avons obtenu des améliorations dans la documentation ici dans la Section 4.
0-9-10 bdcea - unités physiques
Les unités par défaut sont maintenant unités physiques où la base et de gain doit être ajoutée indiqué dans l'en-tête pour chaque canal, de sorte que le signal physique peut être tracée pour le traitement.
rawUnits=1
rawUnits=2
aussi utiliser des unités physiques.rawUnits=3
rawUnits=4
utilisation puis de nouveau analogique/numérique où vous avez besoin de supprimer de la base et du gain.Si vous utilisez
rawUnits=1
ourawUnits=2
, vous avez besoin d'ajuster de base et d'acquérir oùbase = 1024
etgain = 200
Voir le .info fichier ci-dessous où vous pouvez obtenir le
base
etgain
. Il est également l'unité demV
qui suggère que les valeurs doivent être près de2
après la base de gain d'opérations.<0-9-9 bdcea - analogique/numérique unités de base et d'acquérir par défaut; maintenant seulement
rawUnits=3,4
pour les unités analogiquesAprès la sélection de l'ATM, vous devriez être en mesure de voir la liste dans laquelle vous pouvez sélectionner .info fichier après l'exportation, comme décrit dans Kamtal de réponse.
Le .info fichier indique à supprimer les base et gain à partir des données avant de les utiliser
La comparaison de mauvaises réponses! [Obsolète]
Kamtal (maintenant appelé Rashid) réponse est sur le vieux bdcea système utilisé unités numériques sans enlèvement de base et d'acquérir
et vous obtenez la différence entre ma méthode et de sa méthode