Comment décompresser fichier gz à l'aide de Python

J'ai besoin d'extraire un fichier gz que j'ai téléchargé à partir d'un site FTP à un serveur de fichiers Windows. J'ai le jeu de variables pour le chemin d'accès local le fichier, et je sais qu'il peut être utilisé par GZIP la confusion.

Comment puis-je faire cela? Le fichier à l'intérieur du fichier GZ est un fichier XML.

  • Pouvons-nous voir ce que vous avez essayé de s'il vous plaît?
  • Pourquoi est-ce si downvoted? La question ne peut pas être si mauvais étant donné qu'il y a 2 réponses ci-dessus unitaire upvotes.
  • probablement parce que la question ne montre aucune recherche à tous à partir de son auteur.
InformationsquelleAutor Darkdeamon | 2015-06-24
  1. 64
    import gzip
import shutil
with gzip.open('file.txt.gz', 'rb') as f_in:
    with open('file.txt', 'wb') as f_out:
        shutil.copyfileobj(f_in, f_out)
    • pourquoi as-tu mis un second avec? c'est que la pratique courante? vous pouvez ouvrir plusieurs fichiers avec le même gestionnaire de contexte
    • Probablement parce que vous lisez f_in et écrire f_out. Selon les documents, vous devez params pour lire obj et d'une écriture obj, docs.python.org/3/library/shutil.html#shutil.copyfileobj.
    InformationsquelleAutor Matt
  2. 17

    À partir de la documentation: 

    import gzip
f = gzip.open('file.txt.gz', 'rb')
file_content = f.read()
f.close()
    • Merci pour votre réponse, j'obtiens l'erreur ci-dessous:
    • Traceback (most recent call last): File "D:\Scripts\test.py", ligne 68, in <module> oss.downloadFile ('/export/SERVIDOR1/file.xml.gz','d:/test/file.xml.gz') le Fichier "D:\Scripts\test.py", ligne 61, dans downloadFile f = gzip.ouvert(localPath2, "r") le Fichier "C:\Python27\lib\gzip.py", à la ligne 34, en retour ouvert GzipFile(filename, mode, compresslevel) Fichier "C:\Python27\lib\gzip.py", ligne 94, dans init fileobj = auto.myfileobj = intégré.open(filename, mode ou 'rb') IOError: [Errno 22] mode non valide ("rb") ou nom du fichier: 'd:\test\\file.xml.gz'
    • merci de poster votre code dans la question et je vais regarder
    InformationsquelleAutor heinst
  3. 7

    Peut-être vous voulez passer à des pandas aussi.

    with gzip.open('features_train.csv.gz') as f:

    features_train = pd.read_csv(f)

features_train.head()
    • (notez que les pandas devraient lire les fichiers gz directement)
    InformationsquelleAutor Feiyang.Chen
  4. 2
    from sh import gunzip

gunzip('/tmp/file1.gz')
    • Notez que sh ne fait pas partie de l'installation standard.
    InformationsquelleAutor perfecto25
  5. 2

    Pas une réponse exacte parce que vous êtes à l'aide de données xml et il n'y a actuellement aucune pd.read_xml() fonction (en v0.23.4), mais les pandas (en commençant par v0.21.0) peuvent décompresser le fichier pour vous! Merci Wes!

    import pandas as pd
import os
fn = '../data/file_to_load.json.gz'
print(os.path.isfile(fn))
df = pd.read_json(fn, lines=True, compression='gzip')
df.tail()
    • Alors que ce code peut répondre à la question, en fournissant plus de contexte sur comment et/ou pourquoi il résout le problème serait d'améliorer la réponse à long terme de valeur.
    InformationsquelleAutor whs2k