comment faire pour installer les packages R “RNetCDF” et “ncdf” sur Ubuntu?

Je voudrais utiliser les packages R RNetCDF et ncdf dans Ubuntu.

Quand j'essaie install.packages('RNetCDF') ou install.packages('ncdf'), j'obtiens des erreurs similaires:

...
ncdf.c:3:20: fatal error: netcdf.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [ncdf.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘ncdf’
...
Warning message:
In install.packages("ncdf") :
  installation of package ‘ncdf’ had non-zero exit status

Les paquets libnetcdf6 et netcdf-bin à partir du dépôt Ubuntu sont installés. Dois-je faire autre chose?

vous devez installer le -dev de ces paquets pour obtenir les en-têtes qui sont nécessaires pour compiler le paquet.
merci. le seul paquet supplémentaire requis pour ncdf était libnetcdf-dev
pour RNetCDF, udunits-bin et libudunits2-dev sont également nécessaires

OriginalL'auteur Abe | 2012-07-03

  1. 13

    Vous devez installer le -dev de ces paquets pour obtenir les en-têtes qui sont nécessaires pour compiler le paquet. Dans ce cas, vous avez besoin libnetcdf-dev, udunits-bin et libudunits2-dev

    Pour installer le ncdf4 paquet (la mise à jour de la ncdf paquet), j'ai aussi nécessaires à l'exécution de sudo apt-get install netcdf-bin

    OriginalL'auteur Justin

  2. 6

    Dans mon cas, libudunits2 paquet-dev a été nécessaire.

    sudo apt-get install libudunits2-dev

    Depuis que j'ai installé NetCDF à partir de la source, j'ai dû spécifier manuellement l'emplacement de lib et inclure dossiers

    install.packages("/home/user/Downloads/RNetCDF_1.6.1-2.tar.gz", 
repos = NULL,
type="source",
dependencies=FALSE,
configure.args="--with-netcdf-include=/usr/local/netcdf-4.2.1-build/include --with-netcdf-lib=/usr/local/netcdf-4.2.1-build/lib")

    OriginalL'auteur Sadiq Huq

  3. 0

    Juste pour clarifier, car votre délivrance est dans R, et le correctif est appliqué à l'extérieur de R. au début, j'essayais de faire

    installer.les packages("libnetcdf-dev"), qui n'a pas de travail.

    au lieu de cela, à partir de l'extérieur de la R: sudo apt-get install libnetcdf-dev

    Qu'il fixe pour moi.

    OriginalL'auteur AtomicTech