Comment mettre à jour un package dans R?

Je voudrais mettre à jour un package R pour la version la plus récente qui est déjà disponible. J'ai essayé

update.packages(c("R2jags"))

mais il ne fait rien! Pas de sortie sur console, pas d'erreur, rien. J'ai utilisé la même syntaxe que pour install.packages mais peut-être que je suis en train de faire quelque chose de mal. J'ai été à la recherche à ?update.packages mais je n'étais pas en mesure de comprendre comment il fonctionne, d'où pour spécifier le package(s), etc. Il n'y a pas d'exemple. J'ai aussi essayé de mettre à jour le package à l'aide de install.packages à "installer" à nouveau, mais qui dit "Avertissement: le paquet ‘R2jags’ est en cours d'utilisation et ne sera pas installé".

Si vous lisez ?update.pacakges, puis vous remarquerez que le premier argument de update.packages est pas le nom du paquet, mais l'emplacement de la bibliothèque pour vérifier. Si vous voulez mettre à jour un package, utilisez install.packages. L'avertissement que vous rapport vous indique pourquoi il ne fonctionne pas: vous devez cesser d'utiliser le package dans toutes les R les sessions qui sont de l'utiliser. Ceci est plus facilement accompli par la fermeture de la délinquance R sessions.
?Joshua, j'ai vu exactement ce que vous dites dans l'aide - c'est pourquoi j'ai dit que je ne sais pas où indiquer les paquets. Ce n'est pas très intuitive. Qu'est-ce que update.packages, alors?
Le Détails section de update.packages vous raconte son but.
c'est totalement différente. J'ai demandé sur quelle fonction je dois utiliser pour installer le package. Je n'ai pas besoin de modifier quoi que ce soit, pas de trucs, juste pour savoir la fonction. Cette question peut rester ici ainsi les autres utilisateurs à trouver facilement par google.
bon, je vais l'enlever et de laisser le lien en commentaire pour quiconque est à la recherche stackoverflow.com/questions/13163248/...

OriginalL'auteur TMS | 2014-01-30

  1. 11

    Vous ne pouvez pas faire cela, je le crains bien, pas avec update.packages(). Vous devez appeler install.packages("R2jags") à la place.

    Vous ne pouvez pas installer R2jags dans la session en cours, parce que vous l'avez déjà chargé la version actuelle dans la session. Si vous devez enregistrer tous les objets que vous ne pouvez pas facilement recréer, et quittez R. le début d'une nouvelle session R, exécuter immédiatement install.packages("R2jags"), puis, une fois terminé, charger le paquet et de le recharger dans n'importe précédemment enregistré des objets. Vous pourriez essayer de décharger le paquet avec:

    detach(package:R2jags, unload = TRUE)

    mais il est assez complexe de faire cela proprement, à moins que le paquet nettoie après lui-même.

    update.packages() existe pour mettre à jour tous les paquets obsolètes dans un emplacement de la bibliothèque. Que l'emplacement de la bibliothèque est donné par le premier argument (si non fourni, il fonctionne sur tous connu des emplacements de la bibliothèque pour la R de la session). Donc, vous avez été pour lui demander de la mettre à jour les packages dans l'emplacement de la bibliothèque R2jags qui est plus rare d'exister sur votre R installation.

    Gavin, merci!! Donc install.packages fait! Mais le detach chose, séance de clôture, etc. n'est pas nécessaire! Je viens de commencer la nouvelle R et installé depuis! N'aime pas à redémarrer maintenant...
    Bien évidemment, mais l'impression que vous avez donné était que tu voulais la R2jags dans la session en cours. Sinon, quel était le malentendu re le message d'avertissement que vous avez obtenu?
    Gavin, je suis heureux de tester le nouveau package tout d'abord. Eh bien, le malentendu est que je intuitivelly attend à ce que le update.packages fonction est celui qui doit travailler et install.packages ne le ferai pas.
    Attention, vous ne pouvez pas test la R2jags, moins vous installer dans un emplacement de la bibliothèque. Si vous ne le faites pas, l'ancienne version ne sera disponible que dans le cours d'exécution de la session. Il peut aussi y avoir des problèmes avec les fichiers d'aide, etc si vous mettez à jour le paquet (à partir d'une autre session) dans l'emplacement de la bibliothèque, où le paquet a été chargé à partir de la session en cours.

    OriginalL'auteur Gavin Simpson

  2. 9

    En outre, vous pouvez installer RStudio et mise à jour de tous les paquets en allant à la Tools menu et en sélectionnant Check for Package Updates.

    OriginalL'auteur amzu

  3. 0
    # The following two commands remove any previously installed H2O packages for R.
if ("package:h2o" %in% search()) { detach("package:h2o", unload=TRUE) }
if ("h2o" %in% rownames(installed.packages())) { remove.packages("h2o") }

# Next, we download packages that H2O depends on.
pkgs <- c("RCurl","jsonlite")
for (pkg in pkgs) {
if (! (pkg %in% rownames(installed.packages()))) { install.packages(pkg) }
}

# Now we download, install and initialize the H2O package for R.
install.packages("h2o", type="source", repos="http://h2o-release.s3.amazonaws.com/h2o/rel-xia/2/R")

# Finally, let's load H2O and start up an H2O cluster
library(h2o)`enter code here`
h2o.init()

    OriginalL'auteur DJ6968