Comment mettre des bordures noires en heatmap dans la R

Hi
J'ai créé un heatmap dans R à l'aide de "heatmap.plus" qui est indiqué dans le lien

http://i.stack.imgur.com/hizBf.jpg

mais j'ai besoin de la carte de chaleur pour ressembler à la heatmap indiqué dans le lien ci-dessous qui a été créé à partir d'un autre logiciel à interface graphique

http://i.stack.imgur.com/Y8Faj.png

Comment puis-je mettre des bordures noires dans chaque heatmap élément dans la R

Vous avez donc de nombreuses cellules dans votre map, mettre une bordure noire sur chacun de ne pas laisser beaucoup d'espace pour la couleur.
ok, mais est-il de toute façon à mettre des bordures noires comme ça?
vous pouvez le faire directement avec l'image() et abline () et assurez - vous que vous obtenez les coins de ne pas les centres (image peut gérer une ou l'autre) - mais le faire dans le heatmap sera un peu plus compliquée car qui utilise la mise en page pour définir la parcelle
Qu'en blanc frontières? learnr.wordpress.com/2010/01/26/ggplot2-quick-heatmap-plotting

OriginalL'auteur Jana | 2011-02-17

  1. 17

    Si vous suivez le tutoriel de Apprendre R blog et changer de couleur dans ce paragraphe au noir, vous obtiendrez:

    (p <- ggplot(nba.m, aes(variable, Name)) +
    geom_tile(aes(fill = rescale), colour = "black") +
    scale_fill_gradient(low = "white",high = "steelblue"))

    Comment mettre des bordures noires en heatmap dans la R

    OriginalL'auteur Roman Luštrik

  2. 4

    Essayez ceci:

     library(plotrix)

 #Build a 40 Row by 40 Column Matrix
 n <- 40
 mat <- matrix(rnorm(n*n), nrow = n)

 #Plot it
 color2D.matplot(mat, cellcolors = color.scale(mat, c(0,0.5,1), c(1,0.5,0), 0))
    Aussi: lattice::levelplot(mat,border="black")

    OriginalL'auteur bill_080

  3. 1

    Avez-vous essayé d'utiliser heatmap.2? Il a les paramètres pour le faire.

    require("gplots")

data <- # matrix or data frame for your data.

heatmap.2(data, 
          sepwidth=c(0.05, 0.05),  # width of the borders
          sepcolor='black',        # color of the separation lines
          )

    Vous avez besoin de plus dans les paramètres en fonction de ce que vous voulez dans vos graphiques. R de l'aide sur le heatmap.2 fonction couvre pratiquement tout ce dont vous avez besoin: ?heatmap.2

    OriginalL'auteur John Mark