Comment puis-je générer un histogramme pour chaque colonne de mon tableau?

J'ai un tableau de données avec une colonne représentant un laboratoire de la valeur pour chaque sujet de l'étude (lignes).

Je veux générer une série d'histogrammes montrant la distribution des valeurs pour chaque test de laboratoire (c'est à dire la colonne). Chaque ensemble de valeurs de laboratoire idéal serait d'avoir un autre bin largeur (certains sont des entiers avec des centaines, certains sont numériques avec une gamme de 2 ou 3).

Comment dois-je faire?

OriginalL'auteur veldhoen | 2016-02-12

ggplot2 r

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Si vous combinez les tidyr et ggplot2 paquets, vous pouvez utiliser facet_wrap de faire un petit ensemble d'histogrammes de chaque variable dans vos données.cadre.

Vous avez besoin de remodeler vos données de forme longue avec tidyr::gather, de sorte que vous avez key et value colonnes comme tel:
```
library(tidyr)
library(ggplot2)
# or `library(tidyverse)`

mtcars %>% gather() %>% head()
#>   key value
#> 1 mpg  21.0
#> 2 mpg  21.0
#> 3 mpg  22.8
#> 4 mpg  21.4
#> 5 mpg  18.7
#> 6 mpg  18.1
```
À l'aide de ce que nos données, nous pouvons cartographier value que notre variable x, et l'utilisation facet_wrap de séparer par la key colonne:
```
ggplot(gather(mtcars), aes(value)) + 
    geom_histogram(bins = 10) + 
    facet_wrap(~key, scales = 'free_x')
```
La scales = 'free_x' est nécessaire, à moins que vos données sont tout de même échelle.

Vous pouvez remplacer bins = 10 avec quelque chose qui donne un nombre, qui peut vous permettre de définir un peu individuellement avec un peu de créativité. Alternativement, vous pouvez définir binwidth, qui peut être plus pratique, en fonction de ce que vos données ressemble. Peu importe, binning va prendre une certaine finesse.

Voici une approche pour la mise en différents binwidths, si elle est un peu plus compliqué.
J'apprécie vraiment l'aide, j'ai été vraiment l'incompréhension comment le facettage travaillé. Je vais travailler avec le bitwidths l'article que vous avez posté, car elles sont très différentes entre les valeurs. Je vous remercie beaucoup.

OriginalL'auteur alistaire
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Vous pourriez générer des parcelles dans une boucle for avec quelque chose comme cela, si votre bloc de données est nommé "df" et vous voulez générer des histogrammes en commençant par la colonne 2 (si la colonne 1 est votre id):
```
for (col in 2:ncol(df)) {
    hist(df[,col])
}
```
L'hist fonction calcule automatiquement raisonnable bin largeur, ou vous pouvez spécifier un nombre fixe de cycles pour tous les histogrammes, en ajoutant les pauses argument:
```
hist(df[,col], breaks=10)
```
Si vous utilisez RStudio, l'ensemble de vos parcelles seront automatiquement enregistrées dans les parcelles volet. Si non, vous aurez besoin d'enregistrer chaque parcelle dans un fichier séparé à l'intérieur de la boucle, comme expliqué ici: http://www.r-bloggers.com/automatically-save-your-plots-to-a-folder/

C'est super, merci. Le automatique de la parcelle de l'enregistrement est un excellent ajout à ma compréhension.
Vous pouvez ajouter par(mfrow = c(x, y)) pour les afficher dans une parcelle. Ou peut-être rendre le code d'attendre quelque sorte, de sorte que l'utilisateur a le temps de regarder la parcelle et de passer à la suivante. Ou peut-être ajouter un minuteur de veille pour afficher chaque image pour un moment prédéfini. Ou, il suffit d'utiliser quelque chose de semblable à ce que @alistaire fait. 🙂
Je vous suggère d'ajouter main = names(df[col]) comme un argument supplémentaire à la fonction hist. Il va étiquette de chaque histogramme avec le nom de la colonne en question.

OriginalL'auteur Katia
0

Je viens de tomber sur le multi.hist() fonction de la psy paquet . Il vous permet de tracer des histogrammes par des colonnes spécifiques et ressemble, vous pouvez définir différentes pauses pour chaque colonne.

Veuillez également préciser ce qui doit être fait.

OriginalL'auteur kitkat

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