Comment puis-je obtenir toutes les données de sortie à partir d'un script que je suis en cours d'exécution dans RStudio

Je veux voir la sortie d'un script qui a 149 lignes. Tout le chemin à travers le script il y a des tableaux que je veux voir. Je suis à l'aide de RStudio IDE. Dans le passé, j'ai utilisé Tinn-R. je voudrais exécuter le script en entier et les lignes de code et les imprimés les objets sont visibles dans la console.

Par exemple, voici un extrait

attach(uniquehuman.race.eth)
partA.eth <-table(Ethnicity, Sex,useNA="ifany")
partA.eth
margin.table(partA.eth,1)#row totals
margin.table(partA.eth,2)#column totals
nrow(uniquehuman.race.eth)#total logged in

Le code ci-dessus donnerait une sortie de texte les tableaux et les chiffres que j'ai besoin. Je ne puis enregistrer la console ou copier et coller le tout dans un fichier texte.

Comment puis-je le faire dans RStudio? Le plus proche que je viens de frapper CTRL-ENTRÉE sur chaque ligne, mais je ne veux pas faire que 149 fois. Si j'appuie sur CTRL-MAJ-ENTRÉE pour "courir ensemble", puis R les processus de toutes les données et les met les objets en mémoire, mais je ne vois pas la sortie.

S'il vous plaît dites-moi comment je peux voir toutes les données de sortie et/ou d'envoyer la sortie vers un fichier texte.

InformationsquelleAutor Farrel | 2011-04-06

r rstudio text

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Je suis l'un des RStudio développeurs. Merci pour les commentaires--je vais le journal d'un bug.

Dans l'intervalle, une solution de contournement consiste à faire source(filename, echo=T) à partir de la console.
- Yip. Qui ont travaillé. C'est ce que je voulais. Je ne puis copiez et collez la console ou je pourrais entrer dans un évier("filenameIwantforoutput.txt") puis passez votre commande, puis entrez dans l'évier() de nouveau pour arrêter le détournement. Merci beaucoup
- Quel est le statut du bug? Est-il résolu dans RStudio 0.97.173? Je vous remercie.
- Note de RStudio développeurs, ce bug n'a toujours pas été résolu; je suis l'aide de la version Version 0.98.493 et ont encore besoin d'utiliser le "echo=T' Le commentaire ci-dessous se réfère à la RStudio ordinateur portable. Voici l'icône !saisissez la description de l'image ici
- RStudio a maintenant une fonction en haut à droite de l'script du panneau. Il ressemble à un squat ordinateur portable. "Compiler et HTML ordinateur portable à partir du courant de script R" semble faire le travail. Essayez, et dites-moi si ça fonctionne.
- Si vous voulez dire... cliquez sur la petite feuille de calcul' icône... non, ça ne fonctionne pas, n'a jamais montre de 100 variables. Ma solution a été d'envoyer une feuille de calcul excel.
- Je veux télécharger une image pour vous montrer ce que je veux dire par le squat ordinateur portable. Je ne peux pas mettre une image ici. Je vais le mettre dans votre réponse. D'autre part, si vous avez un 100 variables à regarder, vous ne voulez pas de sortie de votre console et ni voulez-vous de HTML portable. Que vous souhaitiez exporter le tableau au format csv et de l'ouvrir dans LibreOffice calc ou des feuilles de calcul Google ou Excel.
InformationsquelleAutor Joe Cheng
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Vous pouvez simplement sélectionner le code que vous voulez exécuter et appuyez sur la CTRL+ENTER à faire ce que vous voulez dans RStudio. Cela fonctionne pour plusieurs lignes, exactement comme dans Tinn-R. Si vous voulez tout à la fois dans un verbeux, vous appuyez sur CTRL-A CTRL-ENTER.

Comme une autre option pour enregistrer dans un fichier texte, vous pouvez vérifier ?sink :
```
sink(file='path/to/somefile.ext')
... # the code generating output
sink()
```
sink() redirige toutes les sorties de la console pour une connexion, dans ce cas, un fichier. Rappelez-vous, ce n'est que la sortie standard, pas les avertissements ou d'erreurs. Cette commande également utile pour créer des fichiers de sortie dans les analyses, en combinaison avec print(), cat(), sprintf() etc.

Si vous utilisez "tout exécuter" dans RStudio, vous devez utiliser explicitement une des fonctions mentionnées à générer la sortie vers le fichier. En principe, RStudio s'exécute en mode silencieux si vous exécutez le script en entier.
- J'ai essayé de l'évier("numbersforeliz.txt") mais il n'est de me donner les dernières lignes de sortie. Il ne me donne pas l'ensemble de la production. C'est la même sortie que je vois dans la Console si j'utilise exécuter tous. Mais je vois beaucoup beaucoup plus si j'appuie sur ctrl-entrée (exécuter lignes) 149 fois.
- il pourrait être que vous devez explicitement imprimer les numéros que vous voulez. D'où ma référence à la cat(), sprintf() et ainsi de suite. Tout ce qui est entre sink(file=...) et sink() qui est imprimé sur la console, normalement, est redirigé vers le fichier spécifié.
- réponse édité avec la manière normale de faire que dans RStudio.
- Je veux RStudio pour exécuter fort ou avec beaucoup de détails. Je veux que chaque ligne de code reproduit dans la console et je veux résultante de sortie imprimée dessous. De sorte que si il ya une ligne de code", nrow(uniquehuman.de course.eth)#total connecté" alors je vais voir ce que dans la sortie et je vais voir un entier sur la ligne suivante. Je reconnais les bonnes pratiques que vous mentionnez, en me disant à propos de print (), mais il serait trop revenir en arrière et modifier tous les scripts que j'ai.
- sélectionnez le code que vous voulez exécuter (plusieurs lignes possibles!) et en appuyant sur CTRL+ENTRÉE ne s'exécutent avec beaucoup de détails. Une option pour l'exécution de tous avec beaucoup de détails n'est pas présent encore. Aller à la RStudio gars et demandez-leur d'ajouter la fonctionnalité, beaucoup de gens aimeraient que. Mais pour l'instant je vous ai donné toutes les options qui sont actuellement disponibles.
InformationsquelleAutor Joris Meys
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Utiliser des options(verbose=TRUE) pour imprimer toutes les données de sortie avec beaucoup de détails tout au long du script ou de la session.
- cela fonctionne parfaitement bien si vous ne se soucient pas de voir des tableaux et d'autres objets, mais sont seulement intéressés par des avertissements, erreurs, et stdout. Mais cela ne répond pas à la question de l'OP
InformationsquelleAutor MarkD

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