Corrélation des rangs de Spearman

je suis en train d'écrire un script qui lit les deux .fichier txt dans deux vecteurs. Après que j'ai envie de faire une corrélation des rangs de Spearman et de tracer le résultat.
Les premiers vecteurs de la valeur de la longueur est de 12 à 13 caractères (par exemple, 7.3445555667 ou 10.3445555667) et la deuxième des vecteurs de la valeur de la longueur est d'un caractère (par exemple, 1 ou 2).

Le code:

vector1 <- read.table ("D:...path.../mytext1.txt", header=FALSE)
vector2 <- read.table ("D:...path.../mytext2.txt", header=FALSE)
cor.coeff = cor(vector1 , vector2 , method = "spearman")
cor.test(vector1 , vector2 , method = "spearman")
plot(vector1.var, vector2.var)

L' .txt fichiers contiennent uniquement des valeurs numériques.

Je reçois deux erreurs, la première dans la ligne 4, c'est comme " 'x' être un numérique, vecteur"
et la deuxième erreur se produit dans la ligne 5, c'est comme "objet vecteur 1.var ne pouvait pas être trouvé"

J'ai aussi essayé

 plot(vector1, vector2)

au lieu de

 plot(vector1.var, vector2.var)

Mais ensuite il y a une erreur du type "Erreur dans stripchart.par défaut (x1,...) : invalides de la parcelle méthode

La mise en œuvre est orientée à http://www.gardenersown.co.uk/Education/Lectures/R/correl.htm#correlation

OriginalL'auteur Tyzak | 2012-04-30

  1. 5

    Je doute vector1 et vector2 sont des vecteurs. La lecture ?read.table on note dans le Valeur section:

    Valeur:

        A data frame (‘data.frame’) containing a representation of the
    data in the file.

    ....

    Donc même si vos deux fichiers texte contient une seule variable, les deux objets de lecture en sera trames de données avec un seul composant chaque.

    Deuxièmement, vos fichiers de données ne contiennent pas d'en-têtes afin de R composent un nom de variable. Je n'ai pas testé mais SI vos variables dans vector1 et vector2 permettra à la fois d'être appelé X1. Ne head(vector1) et la même chose sur vector2 (ou names(vector1)) pour voir comment vos objets dans R.

    Je peux voir pourquoi vous pourriez penser vector1.var pourrait fonctionner, mais vous devez réaliser que, tant pour la R, il a été la recherche d'un objet nommé vector1.var. Le . est juste n'importe quel autre personnage dans la R des noms d'objet. Si vous utilisez . comme un subsetting ou de la sélection de l'opérateur, alors vous avez besoin de lire sur subsetting opérateurs dans R. ce sont $ et [ et [[. Voir, par exemple, la Langage R manuel de Définition ou la R manuel de l'.

    Je soupçonne que vous pouvez simplement modifier votre code pour:

    vector1 <- read.table ("D:...path.../mytext1.txt", header=FALSE)[, 1]
vector2 <- read.table ("D:...path.../mytext2.txt", header=FALSE)[, 1]
cor.coeff <- cor(vector1 , vector2 , method = "spearman")
cor.test(vector1 , vector2 , method = "spearman")
plot(vector1, vector2)

    Mais je suis en supposant un peu sur ce qui est dans vos deux fichiers texte...

    Aussi, l'habitude de contrôles doivent être effectués que R n'a pas converti les données de facteurs de etc. Voir str() comme par @Maiasaura 's Réponse trop.

    OriginalL'auteur Gavin Simpson

  2. 5

    str est une fonction très utile (voir ?str pour plus d') que l'on devrait utiliser souvent, surtout pour vérifier R types d'objet. Un rapide str(vector1) et str(vector2) vous dira si ces colonnes ont été lus comme des caractères au lieu de numérique. Si oui, alors utiliser as.numeric(vector1) de transtypage les données de chaque vecteur.

    Aussi, names(vector1) et names(vector2) vais vous dire ce que les noms de colonne et sont susceptibles de résoudre votre complot en question.

    OriginalL'auteur Maiasaura