Erreur dans l'intrigue.new() : figure marges trop grandes dans la R

Je suis nouveau sur R, mais j'ai fait de nombreuses parcelles de corrélation avec de plus petits ensembles de données. Cependant, lorsque j'essaie de tracer un grand jeu de données de 2 go (+), je peux produire de l'intrigue, mais la légende n'apparaît pas. Tous les conseils? ou des solutions de rechange?

library(gplots)
r.cor <- cor(r)
layout(matrix(c(1,1,1,1,1,1,1,1,2,2), 5, 2, byrow = TRUE))
par(oma=c(5,7,1,1))
cx <- rev(colorpanel(25,"yellow","black","blue"))
leg <- seq(min(r.cor,na.rm=T),max(r.cor,na.rm=T),length=10)
image(r.cor,main="Correlation plot Normal/Tumor data",axes=F,col=cx)
axis(1, at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]], 
    cex.axis=0.9,las=2)
axis(2,at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]],
     cex.axis=0.9,las=2)
image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)

Erreur dans plot.new() : figure marges trop grandes

tmp <- round(leg,2)
axis(1,at=seq(0,1,length=length(leg)), labels=tmp,cex.axis=1)

Vous devez nous fournir un exemple reproductible démontrant les maux que vous rencontrez. stackoverflow.com/questions/12765668/...
J'ai essayé tous les ci-dessus, et rien n'a fonctionné. Cependant, une fois dans un certain temps (au moins pour un débutant comme moi), les données dans une matrice ou un data.cadre peut avoir été contraint de quelque type que vous n'étiez pas au courant de. Dans ce cas, utiliser "que.numérique" avant que vos données pour s'assurer que ce n'est pas le problème.

InformationsquelleAutor Steve Hwang | 2012-10-07

plot r

75

Je soupçonne que le problème, c'est que la petite figure région 2 créé par votre layout() appel n'est pas suffisamment large pour contenir les marges par défaut et, a fortiori, un complot.

Avant de la ligne à l'origine du problème, essayez:
```
par(mar = rep(2, 4))
```
ensuite le tracé de la deuxième image
```
image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)
```
Vous aurez besoin de jouer avec la taille des marges sur les par() appel je montre pour obtenir ce droit. Vous pouvez aussi avoir besoin d'augmenter la taille réelle de l'appareil sur lequel vous tracez.

Un dernier conseil, enregistrez le par() par défaut avant de les modifier, afin de modifier votre par() appel à:
```
op <- par(oma=c(5,7,1,1))
```
puis à la fin de complot en vue de faire
```
par(op)
```
- Ah, merci pour la clarification. J'ai été la manipulation de layout(matrix()) à la place. Apprécions l'aide!
- c'est la bonne astuce pour moi. J'ai dû augmenter la taille de l'image, ou de diminuer la résolution de png(filename="myfile.png", res=150, width = 1000, height = 1000)
InformationsquelleAutor Gavin Simpson
135

Cette erreur peut se produire dans Rstudio tout simplement parce que votre "Parcelles" volet est à peine trop petit. Essayez d'agrandir votre "les Fichiers, plans, Forfaits, de l'Aide, Viewer" et voir si ça aide!
- Cela a résolu mon problème! J'avais élargi "l'Environnement" de la fenêtre, réduire les "Parcelles", etc. de la fenêtre. J'ai juste eu à élargir la fenêtre. Merci!!!!
- D'accord, cela a affecté ma RStudio aussi, et l'expansion de la fenêtre aidé.
- Parfois, j'ai accidentellement à la fin avec un certain nombre de volets en raison de l'utilisation par(). par(mfrow=c(1,1)) pouvez réinitialiser un volet.
- c'était très bizarre d'erreur pour moi depuis que je suis de nouveau à R. n'a Jamais eu de problèmes auparavant avec d'autres langues/IDE où les IDE disposition aura un impact sur mon code!!
- Génial, cela a fonctionné pour moi aussi. Une telle erreur bizarre quand même!!
- Pour moi, la raison en était que le x-axe noms (écrit verticalement) étaient trop long. Agrandir la fenêtre du tracé aidé, mais l'erreur a été causée par trop peu d'espace pour le nom.
InformationsquelleAutor Steve Pitchers
62

Si vous obtenez ce message dans RStudio, cliquant sur le "manche à balai" figure "Effacer Tous les tracés" dans les Parcelles onglet et en essayant de plot() de nouveau, peut travailler.
- C'est la meilleure réponse.
- graphics.off()
- J'aime cette réponse
- C'est vraiment la meilleure réponse. Merci.
- À moins, bien sûr, Steve Lanceurs réponse s'applique...
- Ce devrait être accepté comme réponse.
InformationsquelleAutor Justas
18

J'ai eu cette erreur dans la R Studio, et est tout simplement fixe en faisant de la barre latérale plus grand en cliquant et en faisant glisser sur le bord de la droite vers la gauche.
- wow. excellente solution merci beaucoup le genre
- cela a été le gagnant. Pourquoi est-ce la même chose?
- Aucune des autres solutions n'a fonctionné pour moi à l'exception de celui-ci.
InformationsquelleAutor Janac Meena
18

Cela arrive parfois dans RStudio. Pour le résoudre, vous pouvez tenter de tracer une fenêtre externe (Windows uniquement):
```
windows() ## create window to plot your file
## ... your plotting code here ...
dev.off() 
```
- C'est une meilleure solution que d'acheter un plus grand écran. Il y a aussi un x11() la commande qui devrait fonctionner sur Linux.
- La réponse la plus appropriée jamais. Merci.
- équivalent pour MacOSX ?
InformationsquelleAutor jobligado
10

Vérifier si votre objet est une liste ou un vecteur. Pour ce faire, tapez is.list(yourobject). Si cela est vrai, essayer de le renommer x<-unlist(yourobject). Cette volonté d'en faire un vecteur vous pouvez tracer.
- Cela n'a pour moi (à l'aide de png() / dev.off() dans Rstudio).
InformationsquelleAutor Gina-Maria
5

Juste agrandir cette zone si vous utilisez RStudio.

InformationsquelleAutor vkalit
2

J'ai eu ce message d'erreur quand j'essayais de tracer dimensionnelle élevée des données. Si c'est ce qui se passe avec vous, essayez de multidimensional scaling: http://www.statmethods.net/advstats/mds.html

InformationsquelleAutor Olga Mu
2

J'ai du mal avec cette erreur pendant des semaines (à l'aide de RStudio). J'ai essayé de déplacer la fenêtre du tracé de plus grand et de plus petit, mais qui n'a pas toujours de l'aide. Quand j'ai déménagé (traîné) à l'application à mon plus grand écran, le problème a disparu! J'ai été stupéfait... autant gaspillé des heures... je savais que mon code était correct...

InformationsquelleAutor Liz
0

RStudio Parcelles de la toile est de limiter l'intrigue largeur et de la hauteur. Toutefois, si vous faites votre parcelle de terrain de Rmarkdown morceau de code, il fonctionne sans toile de limites parce que la zone de tracé défini en fonction de la taille du papier.

Par exemple:
```
    ```{r}
#inside of code chunk in Rmarkdown
        grid <- par(mfrow=c(4, 5))
        plot(faithful, main="Faithful eruptions")
        plot(large.islands, main="Islands", ylab="Area")
        ...
        par(grid)
    ```
```
InformationsquelleAutor Suat Atan PhD
0

J'ai trouvé cette erreur aujourd'hui. Au départ, j'essayais de sortie à un .jpeg fichier avec une faible largeur et la hauteur.
```
jpeg("method1_test.jpg", width=900, height=900, res=40)
```
Plus tard, j'ai augmenté la largeur et la hauteur:
```
jpeg("method1_test.jpg", width=1900, height=1900, res=40)
```
L'erreur n'était pas là. 🙂

Vous pouvez également jouer avec la résolution, si la résolution est élevée, vous avez besoin de plus de largeur et de hauteur.

InformationsquelleAutor jaikamal
0

J'ai trouvé la même erreur aujourd'hui. J'ai essayé la fonction "Effacer toutes les Parcelles" bouton, mais il me faisait la même erreur. Alors cette astuce a fonctionné pour moi,
Essayer d'augmenter la zone de traçage par glisser-déposer. Il vous aidera à coup sûr.

InformationsquelleAutor Dhruv Panchal
0

Je viens d'utiliser le Clair de toutes les parcelles, puis de nouveau donner la commande plot et il était serviable
- Bienvenue DONC. S'il vous plaît pouvez-vous expliquer pourquoi c'est la réponse.
InformationsquelleAutor Nirmal Kumar

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