ggplot2 figure taille avec RMarkdown

Mon la conversion du R de script (.R) dans un RMarkdown fichier (.mdm) dans RStudio, puis en appuyant sur “tricot html” résultat dans deux fichiers de sortie (qui est, .html et .md fichiers). Je suis confronter 2 questions:

La html fichier montre que le titre de la ggplot graphique se haché. J'ai changé la largeur d'origine de 11 à une nouvelle largeur de 15:

ggsave(file=outFile, width=15, height=7)

Comment pourrais-je résoudre le problème ? Et comment puis-je convertir des .rapport de fichier dans un fichier PDF ?

OriginalL'auteur user1849365 | 2012-11-24

  1. 22

    Votre question n'est pas très clair. Je ne suis pas sûr, par exemple, pourquoi vous utilisez ggsave() pour commencer. Vous pouvez créer directement un "ggplot" image dans votre fichier de knit et de définir votre figure largeur et la hauteur de votre fichier d'entrée.

    En un ".Mdm" fichier, votre code pourrait ressembler à quelque chose comme:

    ```{r fig.width=7, fig.height=4, echo=FALSE}
library(ggplot2)
qplot(mpg, wt, data=mtcars)
```

    La echo=FALSE fera en sorte que le code ne s'affiche pas, mais l'intrigue va. La figure largeur et la hauteur ont été définies avec les arguments pertinents.

    Si vous vouliez convertir vos résultant des réductions de fichier au format PDF, je vous recommande de regarder Pandoc qui va vous permettre de faire quelque chose comme ce qui suit pour convertir votre fichier au format PDF:

    pandoc infile.md -o outfile.pdf

    Alternativement, vous pouvez utiliser R Sweave au lieu de R Markdown dans la R/RStudio. Par exemple, si vous créez un nouveau "Rnw" fichier dans RStudio et collez le code suivant, vous aurez la possibilité de compiler directement un fichier PDF au lieu de compiler un code HTML.

    \documentclass{article}

\begin{document}

<<fig.width=5, fig.height=3, echo=FALSE>>=
library(ggplot2)
qplot(mpg, wt, data=mtcars)
@

\end{document}
    Première question: j'ai résolu .. en utilisant le \n dans le titre. Mon script R implique (1) des facteurs de création de ggplot et l'impression des résultats, et (2) l'écriture de fonctions qui produisent 5 geom bars et les enregistrer dans le 5 .les fichiers png.
    Je suis désolé, mais sans un exemple de script (merci d'éditer votre question afin de montrer vos données et le contenu de votre fichier Mdm), je ne suis pas en mesure de vous aider. Avez-vous été finalement en mesure de générer un PDF?

    OriginalL'auteur A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1