La régression des tables au format Markdown (pour une utilisation flexible dans R Markdown v2)

La nouvelle version de R Markdown est basé sur pandoc, de sorte que vous pouvez plus simple de changer le format de sortie.

Mon Problème est d'obtenir des réductions de formatage de tableaux provenant, par exemple, les modèles de régression, parce que le LATEX et HTML des tables de ne pas survivre à la pandoc de conversion.

Je sais que les paquets qui génèrent LATEX/sortie HTML à partir d'une variété de modèles (stargazer, texreg, asprtable...) et je suis conscient de fonctions/packages, qui génèrent des réductions de tables à partir de trames de données et de matrices, mais pas à partir d'autres objets.

Des suggestions?

Essayez pander que j'ai commencé pour exactement cet effet: rapporter.github.io/flatter Et Romaine est en train de travailler sur la mise en œuvre de tas de nouveaux S3 méthodes de GSoC 2014, beaucoup de modèles sont déjà inclus -- mais les pls se sentent libre pour proposer de nouvelles demandes de fonctionnalités sur GH.
beau travail
Grâce à ce qui convient à certains de mes besoins! Est-il un moyen de se plier à montrer des résultats à partir d'un série de modèles de régression?
oui, voir par exemple github.com/Rapporter/pander/pull/80

OriginalL'auteur sammerk | 2014-06-21

knitr pandoc r r-markdown

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Mon commentaire ci-dessus dans plus de détails:
1. Définir quelques modèles pour reproductible exemple:
```
lm0 <- lm(hp ~ wt, mtcars)
lm1 <- lm(qsec ~ hp, mtcars)
lm2 <- lm(qsec ~ wt, mtcars)
```
2. Créer un tableau comparatif de ces:
```
require(memisc)
mtable123 <- mtable('Model 1' = lm0,
            'Model 2' = lm1,
            'Model 3' = lm2,
            summary.stats = c('R-squared','F','p','N'))
```
3. Rendre démarque de la table avec un simple appel à pander:
```
pander(mtable123)
```
4. Apprécier le résultat:
```
--------------------------------------------------
     &nbsp;        Model 1    Model 2    Model 3  
----------------- ---------- ---------- ----------
 **(Intercept)**   -1.821\   20.556***\ 18.875***\
                   (32.325)   (0.542)    (1.103)  

     **wt**       46.160***\     \       -0.319\  
                   (9.625)               (0.328)  

     **hp**           \      -0.018***\     \     
                              (0.003)             

  **R-squared**     0.434      0.502      0.031   

      **F**         22.999     30.190     0.945   

      **p**         0.000      0.000      0.339   

      **N**           32         32         32    
--------------------------------------------------
```
Merci pour Romain Tsegelskyi pour la mise en œuvre de cette fonctionnalité intéressante dans GSoC 2014.

Je vois, merci pour les détails. Eh bien, ce n'est certainement pas un markdown question et plutôt pas pertinente dans ce fil, donc si j'étais vous, j'aimerais commencer une nouvelle question sur le. Sinon de recherche pour les mots clés suivants: CSS personnalisé avec knitr.
veuillez vérifier que vous utilisez le plus récente version de pander, car il est très obsolète sur CRAN. Je vais pousser une mise à jour il y dans les prochaines semaines.
êtes-vous à tricoter à partir de RStudio? Probablement, il commence à la vanille, R session sans chargement knitr ou quelque chose. J'ai juste poussé une mise à jour de la GH, s'il vous plaît réinstaller le dev de la version de pander et laissez-moi savoir si cela fonctionne.
ouais, c'est ce que j'ai hier 🙂 Et grâce à un récent mise à jour dans pander, il n'y a pas besoin de spécifier results='asis' plus dans votre morceau d'options lors de l'appel de pander.
J'ai l'impression de recevoir: "Avertissement en abuser.par défaut(m): Pas en abuser.méthode pour "memisc_mtable"" quand j'ai essayer de faire comme vous le suggérez.

OriginalL'auteur daroczig
4

Tout simplement de générer le code HTML ou LATEX tables. Tout ce que vous avez à faire est de simplement ajouter des résultats='asis" pour le code chunk. Elle partira de la sortie comme il est.

Par exemple ce code à l'aide xtable fonctionne pour moi.
```
```{r,results='asis'}
x<-rnorm(100)
y<-rnorm(100)
lm <- lm(y~x)
library(xtable)
print(xtable(summary(lm)),type='html')
```
```
pourriez-vous inclure un minimum de travail exemple, avec explication sur la façon de le compiler?

OriginalL'auteur Koundy
2

Ici ce que j'ai fait quelques heures auparavant:
1. Quelques données:
```
```{r}
  lm1 <- lm(qsec ~ hp, mtcars)
  lm2 <- lm(qsec ~ wt, mtcars)
```
```
2. Nous utiliser le package sjPlot
```
```{r}
  library(sjPlot)
  tab_model(lm1,lm2, file="output.html")# You have to save the table in html format.
```
```
  La partie suivante doit être à l'extérieur du morceau en markdown:
htmltools::includeHTML("output.html")

Cela ne fonctionne pas
pourriez-vous insérer un minimum de travail par exemple?
Cela ne fonctionne pas pour moi, pourriez-vous insérer un exemple minimal, s'il vous plaît 🙂
Fixe. Désolé pour l'erreur
'sjt.lm " est obsolète. L'utilisation de 'tab_model" à la place.

OriginalL'auteur Cro-Magnon

Une autre façon d'utiliser sjPlot (grande bibliothèque pour faciliter la présentation de la régression de sortie) est d'utiliser le pas.fonction de sortie:

     library(sjmisc)
     library(sjPlot)
     library(magrittr)

     lm(qsec ~ wt, mtcars) %>% 
       sjt.lm(no.output = TRUE, show.se = TRUE) %>% 
       return() %>% .[["knitr"]] %>% asis_output

OriginalL'auteur HoneyBuddha

0

Je suis à jour avec un exemple qui utilise le populaire (et plus récent) knitr et kableExtra paquets.
```
library(knitr)
library(xtable)

lm(hp ~ wt, mtcars) %>%
summary() %>%
xtable() %>%
kable()
```
Maintenant, vous pouvez accéder à tous les frais de table fonctionnalités de mise en forme disponibles dans Hao Zhu est kableExtra paquet.

Cela peut-il faire de comparaison de modèles?

OriginalL'auteur John J.
0

La huxtable tenant le paquet peut maintenant imprimer bien mis en forme de régression de la table.
Voir la documentaton https://hughjonesd.github.io/huxtable/huxreg.html

OriginalL'auteur cderv

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