L'analyse arguments de ligne de commande dans la R scripts

Est-il un moyen commode automatiquement analyser les arguments de ligne de commande passé pour R les scripts?

Quelque chose comme perl Getopt::Long?

Liées à la stackoverflow.com/questions/2151212/....

InformationsquelleAutor David B | 2010-08-08

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Il y a trois paquets sur CRAN:
- getopt: C-comme getopt comportement
- optparse: une ligne de commande analyseur inspiré par Python optparse bibliothèque
- argparse: une ligne de commande en option et de position argument de l'analyseur (inspiré par Python argparse de la bibliothèque). Ce paquet nécessite un interpréteur Python soit installé avec le argparse et json (ou simplejson) modules.
Mise à jour:
- docopt: vous permet de définir une interface de ligne de commande par juste une description du format spécifique. C'est un port, d'un docopt.py.
- argparser: multi-plateforme argument de ligne de commande de l'analyseur écrits purement dans la R sans dépendances externes. Ce paquet est utile avec le Rscript front-end et facilite la transformation d'un R de script dans un script exécutable.
- minimist: Une liaison à la minimist bibliothèque JavaScript. Ce module implémente les entrailles de la optimist l'argument de l'analyseur sans la fantaisie de décoration (pas de dépendances externes)
- optigrab: analyser les options de la ligne de commande à l'aide d'un simple, propre syntaxe. Il nécessite peu ou pas de spécification et prend en charge à court et à long options, GNU, Java ou Microsoft de style syntaxes, les verbes et les commandes de plus de.
- Pour une raison quelconque, argparse en fait il faut Python. M'a fait essayer optparse première...
- conseils non sollicités - aussi tentant que cela est l'utilisation de la circulation python argparse paquet de dans R, la croix-langue de dépendance tout à fait de votre script R que beaucoup plus complexe et plus fragile. Ne pas le faire. Utilisez l'une des pur-R options décrites ci-dessus.
InformationsquelleAutor rcs
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La façon la plus simple est d'utiliser commandArgs(). Exemple - pour enregistrer le code ci-dessous comme "des options.R":
```
options <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
options
```
Exécuter à l'aide de "Rscript options.R x y z". Résultat:
```
[1] "x" "y" "z"
```
c'est à dire une liste de 3 éléments, un par argument.
- Ce n'est pas similaire à getopt option de l'analyse.
- Veuillez noter que j'ai répondu à cette presque 7 ans; il est sûr d'être mieux maintenant 🙂
InformationsquelleAutor neilfws
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Juste pour compléter le Rscript réponse:
```
edd@max:~$ r -e 'print(argv)' flim flam flom
[1] "flim" "flam" "flom"
edd@max:~$ 
```
Nous suffit d'utiliser argv dans littler. J'ai eu de la chance avec getopt, le plus vieux des deux disponibles l'analyse des paquets.

InformationsquelleAutor Dirk Eddelbuettel
5

Puis-je vous présenter ArgumentParser dans Xmisc paquet? C'est une ligne de commande analyseur inspiré par Python argparse mais il est Python-gratuit.

http://cran.r-project.org/web/packages/Xmisc/vignettes/Xmisc-ArgumentParser.pdf

InformationsquelleAutor xb.

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