Le stockage d'une liste à l'intérieur d'un bloc de données de l'élément dans la R

Je veux créer une structure de données sous la forme de

Start, End, Elements
  3  , 6  ,  {4,5}
  4 ,  10 ,  {7,8,9}
   ....

Dans les mots, je suis le mouvement d'une bille le long d'une ligne. Le "start" représente le plus à gauche de la position de la balle et la "Fin" représente le plus à droite. Les "Éléments" signifie que j'ai en quelque sorte trouver ces positions particulières. Quelle est la meilleure structure de données à utiliser lorsque le nombre d'éléments peuvent devenir très volumineux? La seule chose que je peux penser est un bloc de données où la 3ème colonne est un bon format de chaîne de caractères. J'aurais alors à analyser la chaîne si je voulais regarder chaque nombre dans l'ensemble. Est-il un meilleur format de données R a ou est-ce?

Merci!

Pourquoi ne pas simplement une liste?
En fait cela a très bien fonctionné et a été facile à mettre en œuvre. Je ne savais pas que un dataframe peut stocker une liste à l'intérieur. Parfait, merci
pourquoi ne pas @joran ou l'OP post cela comme une réponse?

OriginalL'auteur user1357015 | 2013-04-12

  1. 12

    L'option mentionné dans mon commentaire, c'est à dire tout simplement à l'aide d'une liste pour l'une des colonnes:

    dat <- data.frame(Start = 3:4, End = c(6,10))
> dat
  Start End
1     3   6
2     4  10
> dat$Elements <- list(4:5,7:9)
> dat
  Start End Elements
1     3   6     4, 5
2     4  10  7, 8, 9

    Vous pouvez aussi bien sûr fossé des trames de données entièrement et il suffit d'utiliser une bonne vieille liste (qui pourrait faire plus de sens dans beaucoup de cas, de toute façon):

    list(list(Start = 3,End = 6, Elements = 4:5),list(Start = 4,End = 10,Elements = 7:9))
[[1]]
[[1]]$Start
[1] 3

[[1]]$End
[1] 6

[[1]]$Elements
[1] 4 5


[[2]]
[[2]]$Start
[1] 4

[[2]]$End
[1] 10

[[2]]$Elements
[1] 7 8 9
    et si vous utilisez un data.table, vous pouvez tout faire sur une seule ligne: data.table(Start = 3:4, End = c(6,10), Elements = list(4:5, 7:9))
    Oui, mais alors vous devez utiliser données.la table. :p
    pas, get - si ça ne tenait qu'à moi, il n'y aurait plus data.frame':)
    Ou, plus directement: dat <- data.frame(Start = 3:4, End = c(6,10), Elements = I(list(4:5, 7:9)))

    OriginalL'auteur joran

  2. 7

    Vous pouvez stocker comme un grand bloc de données plutôt que large, et probablement utiliser le data.table pour les traiter efficacement. Qui est, faire une ligne par élément, plutôt que d'une ligne par le départ et la fin de la paire de

    library(data.table)
dt = data.table(Start=c(3, 3, 4, 4, 4), End=c(6, 6, 10, 10, 10), Elements=c(4, 5, 7, 8, 9))
#   Start End Elements
#1:     3   6        4
#2:     3   6        5
#3:     4  10        7
#4:     4  10        8
#5:     4  10        9

    Ce serait vous permettent d'effectuer plusieurs types de traitement sur les données très facilement, comme par exemple la détermination de la façon dont de nombreux éléments sont dans chaque gamme:

    dt[, list(Num.Elements=length(Elements)), by=c("Start", "End")]

#    Start End Num.Elements
# 1:     3   6            2
# 2:     4  10            3

    Cela permettrait également de rendre les données facile à utiliser pour les parcelles à l'aide de la ggplot paquet, qui attend généralement des données dans un grand format.

    Vous pourriez noter que cette structure de données gaspillage puisqu'il se répète de Début et de Fin pour chaque élément. Cependant, les tableaux de données sont stockées de manière très efficace - même si votre liste d'éléments est, littéralement, des millions de longue il peut facilement s'intégrer et être traitées de cette manière. Essayez une ligne comme:

    dt = data.table(Start=1:1e6, End=1:1e6, Elements=1:1e6)

    pour une démonstration. Il serait certainement être plus rapide à traiter que de garder chaque élément de la liste en tant que chaîne et se divisant à chaque fois.

    Je ne savais pas que de l'enregistrer dans une liste que joran mentionné ci-dessus est une option. Maintenant, je viens de l'enregistrer en tant que liste d'éléments numériques qui devient facile à faire. Merci pour l'idée, bien que, je n'étais même pas la pensée de format long jusqu'à ce que vous avez mentionné!

    OriginalL'auteur David Robinson