L'extraction d'informations à partir de fichiers Pdf des documents de recherche
J'ai besoin d'un mécanisme pour l'extraction des métadonnées bibliographiques à partir de documents PDF, pour sauver les gens de l'entrer à la main ou couper-coller.
À tout le moins, le titre et le résumé. La liste des auteurs et leurs affiliations serait bon. Extraire les références serait étonnant.
Dans l'idéal, ce serait une solution open source.
Le problème est que pas tous les fichiers PDF encoder le texte, et de nombreux qui ne ne parviennent pas à préserver l'ordre logique du texte, il suffit donc de faire pdf2text vous donne la ligne 1 de la colonne 1, ligne 1 de la colonne 2, ligne 2, colonne 1, etc.
Je sais qu'il y a beaucoup de bibliothèques. C'est l'identification de l'abstrait, titre, auteurs, etc. sur le document que j'ai besoin de résoudre. Ce ne sera jamais possible à chaque fois, mais 80% permettrait d'économiser beaucoup de l'effort humain.
- Cette question est liée à une langue et/ou de la plate-forme?
- Général de la plate-forme UNIX, plus de croix-plate-forme la mieux. L'outil principal (EPrints) est MySQL,Perl,Apache, mais il pourrait shell si nécessaire. Dans l'idéal, cela devrait fonctionner assez vite qu'il fournit la quasi-instantanée des résultats.
- La générosité est une réponse qui peut prendre un fichier PDF et le renvoyer moi un datastucture contenant au moins le titre et le résumé, et est à coût zéro du logiciel. Il ferait beaucoup de bibliothécaires des universités très heureux. Idéalement date, détails de la conférence (le cas échéant), et les références. En utf-8, alors que je suis excessivement optimiste.
- Même si vous pourriez obtenir tous les le texte, comment voulez-vous identifier les titres et résumés? Dans le cas lorsque cette fonction est-elle nécessaire?
- Pouvez-vous indiquer un lien vers un document PDF contenant de telles " métadonnées bibliographiques que vous avez à l'esprit?
- Cette question est maintenant également discuté lors de tex.sx: Comment générer automatiquement BibTeX données
- Je pense que pdfextract paraît utile github.com/Crossref/pdfextract.
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Je suis seulement permis à un lien pour publier ce que c'est:
pdfinfo Linux page de manuel
Ce peut être le titre et les auteurs. Regardez au bas de la page de manuel, et il y a un lien de http://www.foolabs.com/xpdf où l'open source pour le programme peut être trouvé, ainsi que des binaires pour les différentes plates-formes.
De sortir des références bibliographiques, regardez cb2bib:
Vous pouvez également consulter les forums de discussion à http://www.zotero.org où ce sujet a été discuté.
Nous a fait un concours pour résoudre ce problème à Dev8D à Londres, en Février 2010, et nous avons un joli petit GPL outil créé comme un résultat. Nous n'avons pas encore intégré dans nos systèmes, mais il est là dans le monde.
https://code.google.com/p/pdfssa4met/
Peut-être un peu simpliste mais Googler "bibtex + titre de l'article" ussualy vous obtient un formatage entrée bibtex de l'ACM,Citeseer, ou toute autre référence de suivi des sites. Bien sûr, c'est en supposant que le papier n'est pas à partir d'un non-calcul de journal 😀
-- EDIT --
J'ai un sentiment que vous ne trouverez pas une solution personnalisée pour cela, vous pouvez écrire à la citation de trackers comme citeseer, ACM et google scholar pour avoir des idées de ce qu'ils ont fait. Il y a des tonnes d'autres personnes et vous pourriez trouver leurs implémentations ne sont pas à code source fermé, mais pas dans un formulaire publié. Il ya des tonnes de documents de recherche sur le sujet.
L'équipe de recherche, je suis partie de l'a regardé de tels problèmes, et nous sommes venus à la conclusion que la main écrit extraction des algorithmes ou d'apprentissage de la machine sont le moyen de le faire. Écrite à la main algorithmes sont probablement votre meilleur pari.
C'est un problème difficile en raison de la quantité de variation possible. Je suggère à la normalisation du format PDF-texte (ce qui vous obtenez à partir de l'une des dizaines de programmatiques bibliothèques PDF). Vous devez ensuite mettre en œuvre un texte personnalisé démolition des algorithmes.
Je voudrais commencer en arrière à partir de la fin de la PDF et regardez ce genre de citation, il existe des clés-par exemple, [1], [l'auteur-année], (auteur-année) et ensuite essayer d'analyser la phrase suivante. Vous aurez probablement à écrire du code pour normaliser le texte que vous obtenez à partir d'une bibliothèque (en supprimant les espaces superflus et tel). Je tiens seulement à regarder pour la citation de touches que le premier mot d'une ligne, et seulement pour 10 pages par document -- le premier mot doit avoir la clé de délimiteurs -- par exemple, '[' ou '('. Si aucune clés peuvent être trouvés dans les 10 pages alors ignorer le PDF et le drapeau pour l'intervention de l'homme.
Vous pourriez vouloir une bibliothèque que vous pouvez plus par programme à consulter pour la mise en forme de méta-données dans les citations --par exemple, itallics ont une signification spéciale.
Je pense que vous pourriez finir par dépenser assez de temps pour obtenir une solution de travail, puis un processus continu d'adaptation et d'ajouter à la démolition des algorithmes de moteur.
Dans ce cas, je recommanderais TET de PDFLIB
Si vous avez besoin pour obtenir une sensation rapide de ce qu'il peut faire, jetez un oeil à la TET livre de recettes
Ce n'est pas une solution open source, mais c'est actuellement la meilleure option à mon avis. Ce n'est pas de la plate-forme à charge et a un riche ensemble de liaisons de langage et un support commercial.
Je serais heureux si quelqu'un m'a signalé un équivalent ou meilleur alternative open source.
À l'extrait de texte que vous utiliseriez le
TET_xxx()
fonctions et les métadonnées de requête, vous pouvez utiliser lepcos_xxx()
fonctions.Vous pouvez également utiliser le commanline outil pour générer un fichier XML contenant toutes les informations dont vous avez besoin.
Il y a des exemples sur la façon de traiter TETML avec XSLT dans le TET livre de recettes
Ce qui est inclus dans TETML?
Prendre un coup d'oeil à iText. C'est une bibliothèque Java qui vous permettra de lire les fichiers Pdf. Vous serez toujours confrontés au problème de trouver les bonnes données, mais la bibliothèque fournira la mise en forme et mise en page des informations qui pourraient être utilisables pour déduire but.
Une autre bibliothèque Java pour essayer serait PDFBox. Les fichiers pdf sont vraiment conçu pour afficher et d'imprimer, si vous voulez absolument une bibliothèque pour faire le levage lourd pour vous. Même ainsi, vous pourriez avoir à faire un peu de collage de texte morceaux ensemble pour obtenir les données que vous souhaitez extraire. Bonne Chance!
Ont un coup d'oeil à ce document de recherche - Précis d'Extraction d'Informations à partir de Documents de Recherche à l'aide de Champs Aléatoires Conditionnels
Vous pourriez vouloir utiliser un pack open source comme Stanford NER pour obtenir commencé dans les Fec.
Ou peut-être, vous pourriez essayer de les importer (les documents de recherche) à Mendeley. Apparemment, il doit extraire les informations nécessaires pour vous.
Espère que cette aide.
Voici ce que je fais à l'aide de linux et cb2bib.
Répétez cette opération pour tous les documents. Je pense qu'en l'absence d'une méthode fiable d'extraits de métadonnées à partir de fichiers Pdf, c'est la solution la plus simple que j'ai trouvé.
Je recommande gscholar en combinaison avec pdftotext.
Bien que PDF fournit des méta-données, il n'est rempli avec de corriger le contenu. Souvent "None" ou "Adobe Photoshop" ou autres muet chaînes sont en place de la zone de titre, par exemple. C'est pourquoi aucun des outils ci-dessus pourrait tirer de corriger les informations à partir de fichiers Pdf, comme le titre pourrait être n'importe où dans le document. Un autre exemple: beaucoup de papiers, des travaux de la conférence pourrait également avoir le titre de la conférence, ou le nom de l'éditeur qui confond l'extraction automatique des outils. Les résultats sont ensuite trompez lorsque vous êtes intéressé de les véritables auteurs du papier.
Je suggère donc un semi-automatique approche impliquant google scholar.
Donc dans la vraie vie, c'est ce que je fais:
EDIT: attention, vous risquez de rencontrer des captchas. Une autre grande script est bibfetch.
Viens de trouver pdftk... c'est incroyable, vient dans une distribution binaire pour Win/Lin/Mac ainsi que de la source.
En fait, j'ai résolu mon autre problème (regardez mon profil, j'ai demandé ensuite répondu à un autre pdf .. question ne pouvez pas le lien de cause à 1 lien limitation).
Il peut faire pdf extraction des métadonnées, par exemple, ce sera le retour de la ligne contenant le titre:
Il peut vider le titre, l'auteur, mod-date, et même des signets et des numéros de page (test pdf a vos favoris)... évidemment, un peu de travail seront nécessaires pour bien grep la sortie, mais je pense que cela devrait répondre à vos besoins.
Si vos fichiers pdf n'a pas de métadonnées (c'est à dire, pas de "Résumé" de métadonnées), vous pouvez chat le texte à l'aide d'un autre outil comme pdf2text, et d'utiliser certaines grep astuces comme ci-dessus. Si vos fichiers pdf ne sont pas une reconnaissance optique de caractères, vous avez un problème beaucoup plus important, et des requêtes ad hoc de la pdf(s) sera lente et douloureuse (mieux pour OCR).
Peu importe, je vous recommande de créer un index de vos documents au lieu d'avoir chaque requête analyser le fichier de métadonnées/texte.
PyPDF peut-être de l'aide. Il fournit de nombreuses API pour lire et écrire le contenu d'un fichier PDF (non chiffré), et de ses écrits dans une langue facile Python.
Essayer citeyoulike. C'est un site internet qui vous permet de mettre ensemble une bibliothèque de documents, d'attribuer des tags, de recherche, et d'attacher des commentaires. Il vous permet également d'ajouter un bouton à votre navigateur web, ce qui serait d'essayer d'extraire automatiquement les informations que vous souhaitez y compris l'abstrait. Il n'a pas vraiment beaucoup d'un fichier pdf si. Toutefois, si vous le pointez sur une citation pour un papier sur la norme IEEE explorer, citeseer, ou de nombreux journal de sites, il est généralement en mesure d'obtenir toutes les bibtex info.
Le truc, c'est que les fichiers pdf souvent, n'ont pas tous la citation d'informations pour commencer. Vous auriez normalement le titre et les auteurs, mais pas nécessairement le nom de la conférence ou à l'année de publication. Il convient de trouver une citation pour le papier sur siteseer, PubMed, ou dans un autre lieu, et d'en extraire les informations à partir de là.
En général, j'ai trouvé citeyoulike être extrêmement utiles pour l'organisation des documents. Il est également utile pour collaborer avec d'autres personnes. Vous pouvez créer des groupes, partager des documents, de configurer les forums, etc.
CERMINE - Contenu de l'Extracteur et le Mineur
Décrite dans le document: TKACZYK, Dominika, et al. CERMINE: extraction automatique de métadonnées structurées à partir de la littérature scientifique. Journal International sur le Document d'Analyse et de Reconnaissance (IJDAR), 2015, 18.4: 317-335.
Principalement écrit en Java et est disponible en open source à github.