lire.tableau() et de les lire.csv à la fois d'Erreur dans la Mdm

Je veux lire un txt dans Mdm

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title: "Untitled"
output: html_document
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```{r}
country <- read.table("country.txt")
country
```

Il afficher le message d'erreur:

processing file: Preview-2878539db5c7.Rmd

Quitting from lines 6-8 (Preview-2878539db5c7.Rmd) 
Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
Calls: <Anonymous> ... withCallingHandlers -> withVisible -> eval -> eval -> read.table -  > file
Execution halted

Mais je peux exécuter du code dans la R de la console avec succès

> country <- read.table("country.txt")

> country
     production1 education1     fir1 inflation1 lq1 nonstatein1 patent1     tax1   trade1
2001    52920.47   132649.4 2.339263   0.700000  NA    19562.16  109313 23783.07 23783.07
2002    65876.57   144090.3 2.500826  -0.800000  NA    24727.30  131972 27479.61 27479.61
2003    89227.20   156280.4 2.691411   1.168900  NA    34044.45  164611 31537.50 31537.50
2004    92656.06   167683.7 2.615238   3.878600  NA    45613.10  177364 36179.87 36179.87
2005   167115.37   171379.7 2.617289   1.810000  NA    77525.52  231570 42008.37 42008.37
2006   218827.79   181084.6 2.578939   1.467800  NA    77441.52  282315 54866.43 54866.43
2007   286691.88   192677.9 2.439093   4.772700  NA    99032.26  333059 66453.31 66453.31
2008   364955.86   202542.8 2.440807   5.864570  NA   124621.23  418524 74104.80 74104.80
2009   398476.09   213539.2 3.783803  -0.693900  NA   153670.18  537957 65501.69 65501.69
2010   511364.93   254805.1 3.806066   3.322200  NA   194286.94  700304 81966.57 81966.57
2011   624657.55   279690.7 2.862413   5.393433  NA   229513.81  997132 91118.75 91118.75

Le fichier existant dans wd

> file.exists("country.txt")
[1] TRUE

J'ai aussi essayer d'utiliser la lecture.csv()
mais il la même erreur:

processing file: Preview-28786aad2e0.Rmd

Quitting from lines 6-8 (Preview-28786aad2e0.Rmd) 
Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
Calls: <Anonymous> ... withVisible -> eval -> eval -> read.csv -> read.table -> file
Execution halted
  • utilisez le chemin d'accès absolu ou se rendre compte que votre répertoire de travail et l'knitr répertoire peut ne pas être la même
  • +1 pour @rawr de commenter, sauf pour l'utilisation de chemin d'accès absolu 🙂
  • rm -r ~/path/to/daroczig
  • J'ai essayé votre solution mais n'a pas fonctionné.
  • Je voulais dire +1 pour le "rendre compte que votre répertoire de travail et l'knitr répertoire peut ne pas être le même". Ce que tu veux dire avec le rm commande? 🙂
InformationsquelleAutor Liu | 2014-09-14
  1. 28

    La réponse courte est:

    CONNAIS TON getwd()

    Ne pas confondre le répertoire de travail de votre R de la console avec le répertoire de travail de votre R Markdown document (qui est le répertoire de cette R Markdown document). En cas de doute, imprimer getwd() où vous voulez connaître votre répertoire de travail (par exemple dans *.Mdm). Note R Markdown documents sont compilés en séparer R sessions afin d'améliorer la reproductibilité, de sorte que vous R de la console n'a rien à voir avec la compilation de la R Markdown documents.

    • Non, vous sont le plus susceptibles de faire la mauvaise chose si vous trouvez que vous avez à utiliser setwd() ou à l'aide des chemins absolus. Comme je l'ai dit, aller de l'avant et de savoir ce que votre répertoire de travail getwd() est vraiment, et pensez toujours à propos de les chemins d'accès relatifs. Par exemple, si country.txt est dans le même répertoire que votre fichier Mdm, vous n'avez pas besoin de faire quoi que ce soit et vous êtes tous ensemble.
    • Mais il ya des occasions où les fichiers de données peuvent être loin de la code( comme je l'ai garder le code en synchronisation avec un filet de disque, alors que vraiment grand fichier de données d'ailleurs), est-il une option pour définir le knitr document répertoire de travail?
    • Le opts_knit$set(de la racine.dir = 'chemin') ne' t travailler à l'extérieur du document. Pour accéder à d'autres personnes/OS, j'ai besoin de le répertoire de travail, à partir de l'extérieur du document.
    • Les options globales répertoire de travail par défaut paramètre dans Rstudio ne' t de travail pour .Mdm fichiers. Peut-être vous avez besoin de faire clairement la mise est pour .R uniquement les fichiers, et en ajoutant le répertoire de travail de réglage dans le Mdm Document Options de fichier.
    • Vous pouvez toujours utiliser des chemins absolus (par exemple read.csv('/full/path/to/your/data')) si vous n'avez pas besoin d'autres personnes pour reproduire des documents sur les différents ordinateurs.
    • Mais je ne besoin de moi ou d'autres personnes sur un autre ordinateur avec système d'exploitation différent de se reproduire. Peut-être séparer le code pour une .R fichier est un meilleur flux de travail ici.
    • setwd() semble fonctionner, mais dans tous les code chunk il se réinitialise. Aussi longtemps que vous gardez cela à l'esprit, tout ira bien.
    • Je suis d'accord avec @xgdgsc, être capable de setwd() au début du document serait optimal. N'est-il pas un moyen de prévenir tous les code chunk de le réinitialiser?

    InformationsquelleAutor Yihui Xie
  2. 1

    Juste essayer et placer toutes vos données où votre fichier Markdown (.Mdm) réside le fichier.

    InformationsquelleAutor Mohammad Sajid Hussain
  3. 1

    Le mien est un drôle de cas, mais qui peut arriver à quelqu'un d'autre... le Mdm a été enregistré dans mon répertoire de travail par défaut le répertoire de travail où je pensais que j'étais. J'ai eu une longue liste de fichiers et ne savais pas que le script n'était pas là. La peine de vérifier!

    InformationsquelleAutor Picarus
  4. 1

    Votre MDM fichier n'est pas dans votre répertoire de travail courant

    InformationsquelleAutor