Matrice de Distance dans la R

J'ai créer une matrice de distance à l'aide de R. Mes données sont dans un fichier Excel qui contient 300 lignes et 10 colonnes. J'ai créer matrice de distance basée sur les valeurs de la 9e colonne. Par exemple 

   s s s s s
s  1
s  2 2
s  3 3 4
s  4 4 7 3
s  5 5 8 2 8

Comment créer ce type de matrice?

  • Savez-vous comment obtenir les données d'excel dans R? Vous êtes vraiment se poser deux questions.
InformationsquelleAutor akash | 2011-08-03
  1. 8

    Option la plus facile je sais, c'est pour enregistrer votre feuille de calcul Excel contenant les données en tant que fichier CSV. Assurez-vous que seule la première ligne et la colonne de la feuille de contenir de l'échantillon ou des noms de variables.

    Puis lire dans R en utilisant:

    dat <- read.csv("path/to/my/file.csv")

    et ensuite utiliser dist() sur la 9e colonne pour calculer la dissemblance de la matrice

    dij <- dist(dat[, 9])

    Si vous voulez autre chose que de la distance Euclidienne, voir les options dans ?dist et si ceux-ci ne convient pas, essayez la daisy() fonction en recommandé paquet cluster, ou vegdist() fonction dans le paquet vegan ou la proxy paquet.

    • J'ai essayé votre code .Mais j'ai obtenu l'erreur de ce genre.dij <- dist(myfile[, 9]) Erreur dans la myfile[, 9] : nombre incorrect de dimensions
    InformationsquelleAutor Gavin Simpson
  2. 4

    Si vos numéros sont dans un vecteur de z, puis dist(z) renvoie une matrice de distance euclidienne de (sqrt(dx^2+dy^2)) les valeurs. Voir help(dist) pour plus d'info.

    • rapide et sale de réponse est rapide et sale.... Probablement plus que ce que vous pouvez obtenir sur la r-help: "?dist"
    InformationsquelleAutor Spacedman