Plusieurs courbes ROC dans un terrain ou une ROCR

Est-il possible de tracer la courbe roc pour les différentes classificateurs dans la même parcelle à l'aide de la ROCR paquet? J'ai essayé:

>plot(perf.neuralNet, colorize=TRUE)
>lines(perf.randomForest)

Mais j'obtiens:

Error en as.double(y) : 
  cannot coerce type 'S4' to vector of type 'double'

Merci!

InformationsquelleAutor kahlo | 2012-12-29
  1. 36

    Le problème avec votre linesapproche est qu'il n'y a pas de générique S4 lignes de la fonction pour un objet de la classe performance définis dans le ROCR paquet. Mais vous pouvez utiliser le générique de la fonction plot comme vous l'avez fait avec un supplément de add = TRUE argument. Par exemple, c'est en partie à partir de l'exemple de la page de ?plot.performance: 

    library(ROCR)
data(ROCR.simple)
pred <- prediction( ROCR.simple$predictions, ROCR.simple$labels )
pred2 <- prediction(abs(ROCR.simple$predictions + 
                        rnorm(length(ROCR.simple$predictions), 0, 0.1)), 
        ROCR.simple$labels)
perf <- performance( pred, "tpr", "fpr" )
perf2 <- performance(pred2, "tpr", "fpr")
plot( perf, colorize = TRUE)
plot(perf2, add = TRUE, colorize = TRUE)

    OU, vous pouvez stocker toutes vos prédictions dans une matrice et de faire toutes les étapes ultérieures de l'un: 

    preds <- cbind(p1 = ROCR.simple$predictions, 
                p2 = abs(ROCR.simple$predictions + 
                rnorm(length(ROCR.simple$predictions), 0, 0.1)))

pred.mat <- prediction(preds, labels = matrix(ROCR.simple$labels, 
                nrow = length(ROCR.simple$labels), ncol = 2) )

perf.mat <- performance(pred.mat, "tpr", "fpr")
plot(perf.mat, colorize = TRUE)

    Btw, si pour une raison vraiment envie de lines de tracer consécutives courbes ROC vous avez à faire qch. comme ceci:

    plot(perf) 
lines(perf2@x.values[[1]], perf2@y.values[[1]], col = 2)
    • Excellent! Exactement ce que je cherchais!
    InformationsquelleAutor adibender
  2. 2

    Écho @adibender, et l'ajout d'un commentaire: l'exemple ne couvre pas comment définir différentes couleurs pour chaque courbe à l'aide de la seconde (de la parcelle à la fois) approche. Dans ce cas, passer le col comme une liste:

    library(ROCR)
data(ROCR.hiv)
x   <- prediction(ROCR.hiv$hiv.nn$predictions, ROCR.hiv$hiv.nn$labels)
ROC <- performance(x, "tpr", "fpr")
plot(ROC, col = as.list(1:10))
    InformationsquelleAutor Scott Kaiser
  3. 1

    R a des fonctions pour dessiner plusieurs parcelles dans une fenêtre. Et si le logiciel ne prend pas en charge plusieurs parcelles dans une fenêtre,vous pouvez résoudre le problème avec les instruments de base de R. d'Autre moyen: Exemple de plusieurs ROCs
    Article avec ce script:Un exemple de courbes ROC comploter avec ROCR

    • Merci! Le seul problème est que ces solutions semble être pour le cross-validation des données, de sorte qu'il n'est pas possible par exemple d'ajouter une légende à distinguer la courbe appartiennent au classificateur. Et qui sont les instruments pour le dessin de plusieurs parcelles dans la même fenêtre?
    • Vous pouvez utiliser la fonction intrigue secondaire ou voir ce document: [lien] statmethods.net/advgraphs/layout.html
    InformationsquelleAutor psyprog