Pourquoi ne puis-je pas utiliser Unix Nohup avec Bash-boucle?

Par exemple cette ligne échoue:

$ nohup for i in mydir/*.fasta; do ./myscript.sh "$i"; done > output.txt&
-bash: syntax error near unexpected token `do

Quelle est la bonne façon de le faire?

  • Le "pourquoi", c'est que nohup exécute ses arguments avec execv(), et execv() prend un argument vecteur, qui est passé directement au noyau, de ne pas passer par un shell. Ainsi, si vous voulez un shell, vous devez dire à nohup pour exécuter un vous-même.
InformationsquelleAutor neversaint | 2010-06-23
  1. 69

    Parce que "nohup' attend un unique mot de commande et ses arguments - pas une boucle shell de construire. Vous auriez à utiliser:

    nohup sh -c 'for i in mydir/*.fasta; do ./myscript.sh "$i"; done >output.txt' &
    • Cela sera écrit sur output.txt pour chaque fichier? S'il est important d'informations là-bas que vous ne voulez pas remplacé, je voudrais utiliser >> au lieu de >.
    • Si j'ai des données importantes dans output.txt, je ne serait pas la sortie d'un programme, même en mode ajout. Je voudrais créer un nouveau fichier, et seulement quand j'ai été convaincu que les nouvelles données était ce que je voulais aurais-je l'ajouter dans le fichier principal. YMMV, bien sûr.
    • cela ne répond pas à la question. Je crois que cela ne tronque une fois.
    • Je ne suis pas effacer les informations qui ne répond pas à la question. Veuillez clarifier l'ambiguïté du " qui " et "ce", etc.
    InformationsquelleAutor Jonathan Leffler
  2. 9

    Vous pouvez le faire sur une seule ligne, mais vous pourriez le faire demain aussi.

    $ cat loopy.sh 
#!/bin/sh
# a line of text describing what this task does
for i in mydir/*.fast ; do
    ./myscript.sh "$i"
done > output.txt
$ chmod +x loopy.sh
$ nohup loopy.sh &
    • Sauf loopy.sh est dans le chemin, vous avez besoin de l'invoquer comme ./loopy.sh, au moins sur ce Red Hat system, j'ai juste essayé avec.
    InformationsquelleAutor msw
  3. 4

    Pour moi, Jonathan solution n'est pas redirigée correctement output.txt. Celui-ci fonctionne mieux:

    nohup bash -c 'for i in mydir/*.fasta; do ./myscript.sh "$i"; done' > output.txt &

    InformationsquelleAutor Martin
  4. -2

    Vous pouvez aussi l'écrire comme

    for i in mydir/*.fasta; do nohup ./myscript.sh "$i" > output.txt; done &
    • pas vraiment. parce que si la boucle for reçoit le message de déconnexion, il sera interrompu
    • Jup. Nohup doit être le premier depuis nécessaires pour utiliser la commande nohup
    InformationsquelleAutor Ubaldo Porcheddu