Python, comment gérer les “ValueError: non pris en charge pickle protocole: 4” erreur?

Je suis nouveau sur Python.
J'ai pour exécuter cette TargetFinder script ("Analyses Personnalisées").

J'ai installé tous les paquets python, et copié le code dans un script que j'ai nommé main.py, et il a couru.
J'ai eu cette erreur:

[davide@laptop]$ python main.py 
Traceback (most recent call last):
  File "main.py", line 8, in <module>
    training_df = pd.read_hdf('./paper/targetfinder/K562/output-epw/training.h5', 'training').set_index(['enhancer_name', 'promoter_name'])
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/pytables.py", line 330, in read_hdf
    return store.select(key, auto_close=auto_close, **kwargs)
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/pytables.py", line 680, in select
    return it.get_result()
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/pytables.py", line 1364, in get_result
    results = self.func(self.start, self.stop, where)
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/pytables.py", line 673, in func
    columns=columns, **kwargs)
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/pytables.py", line 2786, in read
    values = self.read_array('block%d_values' % i)
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pandas/io/pytables.py", line 2327, in read_array
    data = node[:]
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/tables/vlarray.py", line 677, in __getitem__
    return self.read(start, stop, step)
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/tables/vlarray.py", line 817, in read
    outlistarr = [atom.fromarray(arr) for arr in listarr]
  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/tables/atom.py", line 1211, in fromarray
    return cPickle.loads(array.tostring())
ValueError: unsupported pickle protocol: 4

Je n'ai aucune idée de ce que ce cornichon protocole de moyens, et aussi à mes collègues ne savent rien à ce sujet.

Comment puis-je résoudre ce problème?

Je suis à l'aide de Python 2.7.5 sur un CentOS Linux 7.2.1511 (de Base) système d'exploitation

Comment était le training.h5 fichier produit?
Je ne sais pas: le TargetFinder développeurs de scripts fournis à tous les fichiers
Dans ce cas, vous avez besoin de python 3.4 ou plus tard.

OriginalL'auteur DavideChicco.it | 2016-07-19