Quel est le moyen le plus rapide pour écrire une matrice dans un fichier texte en Octave?

J'ai une matrice de grande taille (2e6 x 3), qui, je dois l'écrire dans un fichier texte.

dlmwrite prend environ 230s pour réaliser cette tâche.

À partir de votre expérience, quel est le moyen le plus rapide d'écrire une grande matrice dans un fichier texte?

Avez-vous essayé le -ascii option de save. C'est, save -ascii output.txt variableName
Avez-vous besoin de simplement enregistrer les données ou est-il besoin d'être formaté dans un fichier texte? @petrichor l'idée devrait fonctionner correctement.

OriginalL'auteur Steven | 2012-10-17

  1. 13

    Ce qui suit s'applique à MATLAB, mais je vous suggère de l'essayer en Octave. Tout d'abord, si vous le pouvez - transposition de la matrice. Voici des exemples d'utilisation de fprintf et csvwrite (essentiellement dlmwrite)

    A = rand(3, 1e6);
tic;
fid = fopen('data.txt', 'w+');
for i=1:size(A, 1)
    fprintf(fid, '%f ', A(i,:));
    fprintf(fid, '\n');
end
fclose(fid);
toc

tic;
csvwrite('data.txt', A);
toc;

Elapsed time is 1.311512 seconds.
Elapsed time is 2.487737 seconds.

    Si non transposée, il faudra les âges, en effet. Par défaut, fprintf vide le tampon après chaque appel. Vous pouvez essayer d'utiliser W au lieu de w pour ouvrir le fichier, mais il n'améliore pas la situation ici, trop.

    Pour info, j'ai essayé csvwrite en Octave et il fonctionne très bien.
    Vous pouvez éviter de manière explicite de la boucle et l'utilisation d'un fprintf(fid,'%f %f %f\n',A) Aussi, fprintf recycle le format appliqué aux variables selon les colonnes. E. g: tic;fid = fopen('data.txt', 'w+'); fprintf(fid, 'a=%f b=%f c=%f\n', A); fclose(fid);toc temps Écoulé est 2.019833 secondes. et donne trois chiffres et un saut de ligne sur chaque 1e6 lignes.

    OriginalL'auteur

  2. 7

    Avez-vous essayé? Je ne suis pas sûr de la vitesse par rapport à dlmwrite.

    a = [1 2;3 4];
save temp.txt a;
    il devrait peut-être être utilisé de cette façon: tic; enregistrer temp.txt A-ASCII; table des matières;

    OriginalL'auteur

  3. 1

    Avoir une variable data vous pouvez l'enregistrer dans un text format avec un espace de valeurs séparées (dont une en-tête):

    save out.txt data

    L'en-tête peut être tout simplement supprimé l'aide de la base de commande Unix queue par exemple (sur n'importe quel Linux/Mac OS):

    tail -n +6 out.txt > file.csv

    OriginalL'auteur

  4. 0

    Théoriquement, selon ce que @angainor dit, on peut encore améliorer les performances
    emballage en quelque sorte

    for i=1:size(A, 1)
   fprintf(fid, '%f ', A(i,:));
   fprintf(fid, '\n');
end

    en blocs pour éviter d'inutiles de la mémoire tampon de rinçage, j'.e.faire 

    1. coverting (in memory) numbers->string + introduction of termination characters '\n' 
   (for say K matrix rows)
2. writing of the obtained string to file through fscanf.

    Devraient essayer..

    OriginalL'auteur

  5. 0

    L'utiliser dans Matlab:

     save -ascii output.txt variableName

    Utiliser cette Octave:

     save hello1.m variableName -ascii

    OriginalL'auteur