R cauchemar: Yosemite, R, RStudio et Homebrew
J'utilise un MacBook Pro 13" Retina (Fin 2013) avec OS X Yosemite 10.10.2. Je ne souhaiterais pas à mon pire ennemi. Eh bien peut-être.
Cauchemar dans l'ordre chronologique:
- Téléchargé R et RStudio des sites officiels.
- Exécuté deux applications à quelques reprises, fine.
- Installé Homebrew. Couru "brew doctor" dans le Terminal. Brew médecin a dit que la R des fichiers ont été problématique.
- RStudio a commencé à agir bizarre.
- Téléchargé ggplot2 package R via CRAN miroir. 5 go de données bouché les "private/var" fichier. Supprimé des données là-bas.
- Mac flippé. La panique du noyau jusqu'à ce qu'un Apple Store Genius effacé le Mac et de le réinstaller OS X.
Je veux continuer à l'aide de R et RStudio. Questions:
- Comment puis-je aller à ce sujet sans faire exploser le Mac nouveau?
- Comment faire pour installer R et RStudio via Homebrew?
- Dois-je installer XQuartz premier?
- Qu'arriverait-il si j'installe R et RStudio unbrewed?
- Ce que les conflits entre R, RStudio et Homebrew dois-je le reconnaître?
- Commune bizarreries de l'ensemble du Homebrew, R et RStudio installé?
- Comment puis-je faire Homebrew, R et RStudio vivre heureux sans brûler la maison?
Merci!
source d'informationauteur Elan
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N'essayez pas de supprimer le fichier d'échange, tandis que l'ordinateur est en marche! Si vous commencez à supprimer aléatoire du système de fichiers que vous allez avoir une mauvaise journée.
Vous pouvez installer R avec
brew install r
. Vous pouvez installer un binaire RStudio à l'aide de homebrew-fût, commebrew install Caskroom/cask/rstudio
.Non, ce ne devrait plus être nécessaire.
Rien de mauvais;
brew doctor
peuvent conclusions du rapport, mais ce ne sont pas des erreurs et vous ne devriez pas supposer qu'ils représentent des problèmes, si elles sont utiles pour les responsables comme moi si vous chercher de l'aide essayer de diagnostiquer les échecs de compilation plus tard.Il n'existe pas de conflits importants. Si vous installez les compilateurs de http://r.research.att.com/libs/qui sont inutiles si vous utilisez une brassée R, vous pourriez avoir de la difficulté à installer des choses comme gcc (qui fournit gfortran) à partir de Homebrew.
En août 2015 les commentaires ci-dessous ne sont plus nécessaires; les paquets sont désormais installés dans /usr/local/lib/R/x.y/site-de la bibliothèque par défaut et doit survivre mineur R les mises à niveau.
Si vous utilisez une brassée de R et que vous souhaitez que vos paquets installés pour survivre mineur R les mises à niveau, vous pouvez exécuter
mkdir -p ~/Library/R/3.2/library
puis R installera les paquets pour que le chemin d'accès par défaut (en plaçant le colis dans votre répertoire maison et pas dans la Cave).Voir ci-dessus!
Regardant en arrière sur cette question, compte tenu de toutes les observations utiles et les réponses, sur le téléchargement de packages R sur un Mac avec R et Homebrew déjà installé:
Le faire dans la R de la console à l'intérieur de l'interface RStudio, simplement en tapant
install.packages("name of the package")
Depuis que j'avais commencé le téléchargement de packages R directement dans RStudio, je n'avais pas eu de problèmes. Le système est très heureux.