R erreur dans glmnet: NA/NaN/Inf étrangères appel de fonction

Je suis en train de créer un modèle à l'aide de glmnet, (actuellement à l'aide de cv pour trouver la valeur lambda) et j'obtiens une erreur NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 5). Je crois que cela a quelque chose à voir avec la NA valeurs dans mon jeu de données, parce que quand j'ai supprimer tous les points de données avec des NAs de la commande s'exécute correctement.

J'étais sous l'impression que glmnet peut poignée NA valeurs. Je ne suis pas sûr de l'endroit où l'erreur provient de:

> res <- cv.glmnet(features.mat, as.factor(tmp[,"outcome"]), family="binomial")
Error in lognet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, alpha, nobs,  : 
  NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 5)

Le jeu de données ressemble à quelque chose comme ceci:

> head(features.mat)
6 x 8 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
   a b   c  e  f  g  h i
1  1 1 138 NA NA 15 NA .
4  1 3 171 NA NA 17 NA .
7  1 1 156 NA NA  5 NA .
8  1 4  97 NA NA  7 NA .
9  1 1 219 NA NA 11 NA .
10 1 . 263 NA NA 20 NA .
> head(as.factor(tmp[,"outcome"]))
[1] 0 0 0 0 0 0
Levels: 0 1

OriginalL'auteur mgoldwasser | 2014-02-18