R ggplot2 scale_y_continuous : la Combinaison des pauses & limites

Problème: je ne trouve aucun moyen de combiner les pauses et les limites des commandes dans ggplot2. L'axe y doit toujours contenir la gamme de 0-40 et breaks=c(5,10,15,20,25,30,35). L'axe x doit être de 0 à 100, breaks=c(10,20,30,40,50,60,70,80,90,100). Je ne veux PAS d'affichage des données en dehors de cette plage.

J'ai essayé + ylim, mais cela écrase mes pauses.
J'ai essayé + expand, mais cela montre aussi des données en dehors de la gamme que je veux(1-100).
J'ai essayé les deux en ajoutant les pauses et la limitation de la plage, dans une deuxième étape, mais l'axe des y de ma première étape est tout simplement écrasé si je le fais.

plot_Tili_Age_VS_Height <- ggplot(Tili, aes(x = Age, y = Height)) + geom_point() + 
geom_smooth(method = "lm", se = FALSE, color = "black", formula = y ~ x) + 
scale_y_continuous(trans = "log10", breaks = c(5, 10, 15, 20, 25, 30, 35)) + 
expand_limits(y = c(0, 35), x = c(0, 100)) + 
scale_x_continuous(trans = "log10", breaks = c(10, 20, 30, 40, 50, 60,70, 80, 90, 100)) +
theme_bw(base_size = 15) + 
theme(panel.grid.major = element_blank(), panel.grid.minor = element_blank())
df <- data.frame(x = log(Tili$Age), y = log(Tili$Height))
lm_eqn = function(df) {
m = lm(y ~ x, df)
eq <- substitute(ln(italic(y)) == a + b %*% ln(italic(x)) * "," ~ ~italic(r)^2 ~ 
"=" ~ r2, list(a = format(coef(m)[1], digits = 2), 
b = format(coef(m)[2], digits = 2), 
r2 = format(summary(m)$r.squared, digits = 2)))
as.character(as.expression(eq))
}
plot_Tili_Age_VS_Height <- plot_Tili_Age_VS_Height + 
annotate("text", x = 30, y = 5, label = lm_eqn(df), hjust = 0, 
size = 3, family = "Times", parse = TRUE)
plot_Tili_Age_VS_Height

Une idée de comment résoudre ce problème?

  • Est Tili construit dans le dataset? Pouvez-vous faire de cette reproductible pour d'autres?
  • Avez-vous essayé d'utiliser le limits argument, par exemple, scale_x_continuous?
  • Se débarrasser de expand_limits(), ne pas utiliser de ylim ou xlim, il suffit d'utiliser scale_y_continuous et scale_x_continuous, ils prennent à la fois breaks et limits arguments.
  • J'ai essayé de faire un exemple reproductible mais mon code ne fonctionne pas plus avec d'autres données. Désolé pour ça! 🙁 Cependant, je crois qu'il n'a pas vraiment d'importance dans mon exemple à ce que les données, le problème est que le ggplot grammaire ne me laisse pas combiner les limites de = et les pauses =, donc j'ai pensé qu'il devrait être correct sans données
  • Oui je l'ai fait. Il remplace également les pauses.
  • oui, ils ne prennent les arguments, mais si j'ai des limites d'utilisation ET les pauses, R jeux de hasard pauses au lieu d'utiliser la mienne et je ne peux pas comprendre pourquoi.

InformationsquelleAutor Baycat | 2016-07-11
  1. 2

    Comme JasonAizkalns a commenté votre problème ne peut être résolu sans n reproductible exemple. Le code ci-dessous fait ce que vous voulez sur les données de l'iris et devrait fonctionner pour votre exemple, en tant que bien.

    library(ggplot2)
df <- iris
## all data, default breaks
ggplot(df, aes(Sepal.Length, Sepal.Width)) +
geom_point()
## subset of data is seen in plot, breaks changed
ggplot(df, aes(Sepal.Length, Sepal.Width)) +
geom_point() + 
scale_x_continuous(breaks = c(5.5,6.5), limits = c(5,7)) +
scale_y_continuous(breaks = c(3.5,2.5), limits = c(2,4))
    • Grâce à vous, tout à coup, il a travaillé à combiner des sauts et des limites, même si j'ai couru le même code qu'hier (et avait relancé le programme entre les deux). Possible de redémarrer l'ordinateur a fait le tour. Donc scale_x_continuous(breaks = c(5.5,6.5), limits = c(5,7)) était la solution! Ce que vous devez garder à l'esprit si vous utilisez le journal des données transformées comme moi, c'est que si vous mettez simplement c(0,40) ou similaire, vos données peuvent apparaître très petite que la distance de 0 à la première pause (10 dans mon cas) est grand et il peut être préférable d'utiliser la vraie limite inférieure de vos données (4.4 dans mon cas).
    • Comment serait-ce de travailler lors de la modification de l'axe des y pour afficher un journal 10 de l'échelle? Je suis spécifier des trans, des pauses et des étiquettes, mais veulent aussi augmenter légèrement l'axe des y de la gamme de ce qu'il est tracé sur son propre. Je veux que mon axe y à la durée de 0,5 à 3,5 (en log10). Comment puis-je intégrer des limites dans ce morceau de code? scale_y_continuous(trans = log10_trans(), breaks = trans_breaks('log10', function(x) 10^x), labels = trans_format('log10', math_format(.x)))
    InformationsquelleAutor yoland