seaborn heatmap à l'aide de pandas dataframe
J'ai du mal à massage un dataframe dans les pandas dans le format correct pour seaborn la heatmap (ou matplotlib vraiment) pour faire une heatmap.
Mon dataframe (appelé data_yule) est:
Unnamed: 0 SymmetricDivision test MutProb value
3 3 1.0 sackin_yule 0.100 -4.180864
8 8 1.0 sackin_yule 0.050 -9.175349
13 13 1.0 sackin_yule 0.010 -11.408114
18 18 1.0 sackin_yule 0.005 -10.502450
23 23 1.0 sackin_yule 0.001 -8.027475
28 28 0.8 sackin_yule 0.100 -0.722602
33 33 0.8 sackin_yule 0.050 -6.996394
38 38 0.8 sackin_yule 0.010 -10.536340
43 43 0.8 sackin_yule 0.005 -9.544065
48 48 0.8 sackin_yule 0.001 -7.196407
53 53 0.6 sackin_yule 0.100 -0.392256
58 58 0.6 sackin_yule 0.050 -6.621639
63 63 0.6 sackin_yule 0.010 -9.551801
68 68 0.6 sackin_yule 0.005 -9.292469
73 73 0.6 sackin_yule 0.001 -6.760559
78 78 0.4 sackin_yule 0.100 -0.652147
83 83 0.4 sackin_yule 0.050 -6.885229
88 88 0.4 sackin_yule 0.010 -9.455776
93 93 0.4 sackin_yule 0.005 -8.936463
98 98 0.4 sackin_yule 0.001 -6.473629
103 103 0.2 sackin_yule 0.100 -0.964818
108 108 0.2 sackin_yule 0.050 -6.051482
113 113 0.2 sackin_yule 0.010 -9.784686
118 118 0.2 sackin_yule 0.005 -8.571063
123 123 0.2 sackin_yule 0.001 -6.146121
et de mes tentatives à l'aide de matplotlib était:
plt.pcolor(data_yule.SymmetricDivision, data_yule.MutProb, data_yule.value)
qui a jeté l'erreur:
ValueError: not enough values to unpack (expected 2, got 1)
et la seaborn tentative:
sns.heatmap(data_yule.SymmetricDivision, data_yule.MutProb, data_yule.value)
qui a jeté:
ValueError: The truth value of a Series is ambiguous. Use a.empty, a.bool(), a.item(), a.any() or a.all().
Il semble trivial que les deux fonctions veulent rectangulaire dataset, mais il me manque quelque chose, clairement.
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Les données doivent être "pivoté" à ressembler à
Ensuite, vous pouvez passer le tableau 2D (ou DataFrame) à
seaborn.heatmap
ouplt.pcolor
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