Simple reconnaissance de l'objet

J'ai utilisé pour faire ce type d'analyse sur les micrographies et finalement mis tout ce que j'ai besoin d'un traitement de l'image et de l'analyse du package écrit en C, par l'intermédiaire d'Tcl. (Il a travaillé avec 512 x 512 uniquement des images, ce qui explique pourquoi 512 cultures si souvent. Il y avait des images avec des pixels de différentes tailles alloué, mais la plupart du travail a été fait sur 8 bits pixels, ce qui explique pourquoi il n'y a que des affaires de 0xff et le maximum de sens comte de 254 sur une image.)

Brièvement, le " zz " au début de l'commandes Tcl envoie le reste de la ligne pour le paquet de l'analyseur qui appelle à la appropriée de routine C avec les arguments donnés. Juste après le " zz " est un argument qui indique l'entrée et la sortie de la commande. (Il peut y avoir plusieurs entrées, mais une seule sortie.) "r" indique une 512 x 512 x 8 bits de l'image. Le troisième mot est le nom de la commande pour être utilisé, les graphiques, les " marques d'une image comme décrit dans le texte ci-dessous. Donc, "zz rr graphiques "signifie" Appeler le ZZ de l'analyseur; l'entrée d'une de la r de l'image pour les graphiques de la commande et obtenir un r image". Le reste de la Tcl ligne de commande spécifie de la pré-alloué des images à utiliser. (Le " g " de l'image est un ROI, c'est à dire, de la région d'intérêt, de l'image; presque tous les ZZ, les op sont fait en vertu de ROI de contrôle.) Donc, 'r1 r1 g8 "signifie" Utiliser r1 entrée, utiliser r1 sortie (qui est, de marquer l'entrée de l'image elle-même), et de faire l'opération, où le pixel correspondant de l'image du g8 --- qui est, r8, utilisé comme un ROI - - - >0.

Je ne pense pas qu'il est disponible en ligne n'importe où, mais si vous voulez récupérer le code source ou même de compiler tout le toutim, je serai heureux pour vous l'envoyer. Voici un extrait du manuel (mais je pense que j'en vois quelques erreurs dans le manuel, à cette date tardive --- c'est embarrassant ...):

L'exemple 6. Le comptage des fonctionnalités.

Problème

De comptage est une tâche commune. Les éléments comptés sont appelées “fonctions”, et il est habituellement nécessaire pour préparer des images avec soin afin que les caractéristiques correspondent à une un-à-un avec les choses qui sont les objets réels pour être comptés. Ici, cependant, nous ignorons préparation de l'image et d'envisager, au lieu de cela, la mécanique de comptage. Le premier comptage de l'exercice est de découvrir comment de nombreuses fonctionnalités sont sur les images dans le répertoire ./les cellules?

Approche

Tout d'abord, laissez-nous définir la “fonctionnalité”. Une fonction est le plus grand groupe de “set” (non nulle) de pixels qui peut être atteint en voyageant d'un pixel à l'autre nord-sud-est-ouest (haut-bas-droite-gauche) routes, à partir d'un ensemble donné de pixels. Le zz commande qui détecte et les marques de ces caractéristiques sur une image est “zz rr graphiques R:src R:dest G:ROI”, ainsi appelé parce que le terme mathématique pour une telle fonction est un “graphe”. Si tous les pixels d'une image sont fixés, alors il n'existe qu'un seul graphique sur l'image, mais il contient 262144 pixels (512 * 512). Si les pixels sont définies et claires (égal à zéro) dans un motif en damier,
ensuite, il y aura 131072 (512 * 512 /2) les graphiques, mais chacun ne contenant qu'un seul pixel.
Brièvement expliqué, “zz rr graphiques” commence dans le coin supérieur gauche de l'image et analyse chaque
rangée de gauche à droite jusqu'à ce qu'il trouve un ensemble de pixels, puis trouve l'ensemble des pixels attachées à travers le nord, le sud, l'est ou à l'ouest des frontières (“4-connecté”). Il définit ensuite l'ensemble des pixels qui le graphique 1 (0x01). Après la découverte et le marquage graphique 1, il commence à numériser à nouveau au pixel après celui où il a d'abord découvert le graphique 1, cette fois en ignorant les pixels qui appartiennent déjà à un graphe. La première 254 graphiques qu'il trouve sera marqué de façon unique; tous les graphiques trouvé après cela, cependant, sera marqué avec la valeur 255 (0xff)
et ne peuvent donc pas être distingués les uns des autres. La clé pour être en mesure de compter le nombre de graphes avec précision est de traiter chaque image dans les stades, c'est trouver le nombre de graphes sur une image et, si le nombre est supérieur à 254, effacer les 254 graphiques viens de trouver, en répétant le processus jusqu'à 254 ou moins graphiques sont trouvés. Le langage Tcl fournit les moyens de faire le contrôle de cette opération.

Laissez-nous commencer à générer les commandes nécessaires à la lecture d'un ZZ fichier d'image dans une de la R de l'image et la détection et le marquage des graphiques. Avant la boucle de traitement, nous déclarons et zéro d'une variable qui contiendra le nombre total de caractéristiques dans l'image de la série. À l'intérieur de la boucle de traitement, nous commençons par la lecture du fichier d'image dans une de la R de l'image et la détection et le marquage des graphiques.

zz ur to $inDir/$img r1
zz rr graphs r1 r1 g8

Ensuite, nous avons zéro des variables à garder la trace des comtes, puis utilisez le “ra max” commande pour savoir si plus de 254 graphiques ont été détectés.

set nGraphs [ zz ra max r1 a1 g1 ]

Si nGraphs ne l'égalité 255, puis l'254 compté correctement graphiques doivent être ajoutés au total, les graphiques de 1 à 254 doivent être effacées, et le comte répété autant de fois qu'il le faudra à réduire le nombre de graphes ci-dessous 255.

while {$nGraphs == 255} {
  incr sumGraphs 254
  zz rbr lt r1 155 r1 g1 0 255 
  set sumGraphs 0
  zz rr graphs r1 r1 g8
  set nGraphs [ zz ra max r1 a1 g8 ]
}

Lorsque la boucle “while” les sorties, la variable nGraphs doit détenir un nombre inférieur à 255, qui est, un certain nombre de décompte précis des graphiques; il est ajouté à l'augmentation totale du nombre de fonctionnalités à l'image de la série.

incr sumGraphs $nGraphs

Après la boucle de traitement, d'imprimer le nombre total de caractéristiques qui se retrouvent dans la série.

puts “Total number of features in $inDir \
images $beginImg through $endImg is $sumGraphs.”

Après la boucle de traitement, d'imprimer le nombre total de caractéristiques qui se retrouvent dans la série.

OpenCV a un Python interface que vous pourriez trouver utiles.