Traçage de l'arbre de décision, graphvizm pydotplus

Je suis en suivant le tutoriel pour arbre de décision sur scikit de la documentation.
J'ai pydotplus 2.0.2 mais il me dit qu'il n'a pas write méthode de l'erreur ci-dessous. J'ai eu du mal pendant un certain temps maintenant, toutes les idées, s'il vous plaît? Merci beaucoup!

from sklearn import tree
from sklearn.datasets import load_iris

iris = load_iris()
clf = tree.DecisionTreeClassifier()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)

from IPython.display import Image

dot_data = tree.export_graphviz(clf, out_file=None)
import pydotplus

graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)

Image(graph.create_png())

et mon erreur est

    /Users/air/anaconda/bin/python /Users/air/PycharmProjects/kiwi/hemr.py
Traceback (most recent call last):
  File "/Users/air/PycharmProjects/kiwi/hemr.py", line 10, in <module>
    dot_data = tree.export_graphviz(clf, out_file=None)
  File "/Users/air/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/tree/export.py", line 375, in export_graphviz
    out_file.write('digraph Tree {\n')
AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'write'

Process finished with exit code 1

----- Mise à JOUR -----

À l'aide de la fixer avec out_file, il jette une autre erreur:

 Traceback (most recent call last):
  File "/Users/air/PycharmProjects/kiwi/hemr.py", line 13, in <module>
    graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)
  File "/Users/air/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pydotplus/graphviz.py", line 302, in graph_from_dot_data
    return parser.parse_dot_data(data)
  File "/Users/air/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pydotplus/parser.py", line 548, in parse_dot_data
    if data.startswith(codecs.BOM_UTF8):
AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'startswith'

---- Mise à JOUR 2 -----

Aussi, se ma propre réponse ci-dessous qui résout un autre problème

OriginalL'auteur Jan Sila | 2016-10-10

  1. 7

    Le problème, c'est que vous êtes le paramètre out_file à None.

    Si vous regardez la la documentation, si vous le réglez à None il renvoie la string fichier directement et de ne pas créer un fichier. Et bien sûr, un string ne dispose pas d'un write méthode.

    Par conséquent, procédez comme suit :

    dot_data = tree.export_graphviz(clf)
graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)
    Ok, merci. Vous avez raison, c'est une erreur dans le tutoriel en lui-même! mais je suis toujours des erreurs avec les analyseurs. Pourriez-vous s'il vous plaît avoir un coup d'oeil? Traceback (most recent call last): File "/Users/air/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pydotplus/graphviz.py" de ligne, 302, dans graph_from_dot_data retour de l'analyseur.parse_dot_data(données) File "/Users/air/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pydotplus/parser.py" de ligne, 548, dans parse_dot_data si les données.startswith(codecs.BOM_UTF8): AttributeError: 'NoneType' object n'a pas d'attribut "startswith'
    Pourriez-vous mettre à jour dans votre question ? c'est plus lisible !
    bien sûr, merci beaucoup pour votre effort!
    Essayez ceci dans votre importation : from pydotplus import graphviz et puis : 'graph = graphviz.graph_from_dot_data(dot_data)'
    graph_from_dot_data() ne fonctionne toujours pas pour moi. J'ai eu à utiliser graph_from_dot_file() plutôt que @Vadym Pasko est proposée ci-dessous

    OriginalL'auteur MMF

  2. 2

    Méthode graph_from_dot_data() n'a pas fonctionné pour moi, même après avoir spécifié le chemin d'accès approprié pour out_file.

    Au lieu d'essayer en utilisant graph_from_dot_file méthode:

    graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_file("iris.dot")
    J'ai essayé ça aussi, mais pas de succès avec ça :/ mais un bon point! J'ai un problème avec le graphviz

    OriginalL'auteur Vadym Pasko

  3. 1

    J'ai rencontré la même erreur ce matin. J'utilise python 3.x et voici comment je résoudre le problème.

    from sklearn import tree
from sklearn.datasets import load_iris
from IPython.display import Image
import io

iris = load_iris()
clf = tree.DecisionTreeClassifier()
clf = clf.fit(iris.data, iris.target)

# Let's give dot_data some space so it will not feel nervous any more
dot_data = io.StringIO()
tree.export_graphviz(clf, out_file=dot_data)
import pydotplus

graph = pydotplus.graphviz.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())
# make sure you have graphviz installed and set in path
Image(graph.create_png())

    si vous utilisez python 2.x, je crois que vous avez besoin de changer "importer io":

    import StringIO

    et,

    dot_data = StringIO.StringIO()

    Espère que cela aide.

    OriginalL'auteur zongyan

  4. 0

    Aussi un autre problème a été la backend paramètres de mon Graphviz!! Il est résolu bien ici. vous avez juste besoin de recherche qu'fichier de paramètres et de modifier en arrière-plan, ou dans le code mpl.use("TkAgg") comme l'a suggéré il y a dans les commentaires. Après je ne suis d'erreur que pydotplot ne pouvais pas trouver mon Graphviz exécutable, donc j'ai réinstallé Graphviz via homebrew: brew install graphviz qui a résolu le problème et je peux faire des parcelles maintenant!!

    Haha pouvez-vous upvote vos propres réponses ? Je ne le savais pas 😀
    Lol tu ne peux pas upvote, mais je dois l'ai accidentellement l'accepter au lieu de la vôtre 😀 je vais le remettre.

    OriginalL'auteur Jan Sila

  5. 0

    Ce qui m'a vraiment aidé à résoudre le problème était le suivant:-
    J'ai exécuté le code à partir de la même utilisateur à travers lequel graphviz a été installé. Si l'exécution de tout autre utilisateur donner votre erreur

    OriginalL'auteur K.S.