Utilisation de AWK pour trouver le plus petit et le plus grand nombre dans une colonne?

Si j'ai un fichier avec quelques colonnes et je veux utiliser un AWK commande pour afficher le plus grand et le plus petit nombre dans une colonne particulière!

exemple:

Je veux que ma commande à montrer que le numéro le plus bas est de 23
et une autre commande-à-dire le nombre le plus élevé est de 323

Je n'ai aucune idée pourquoi les réponses ne sont pas de travail! J'ai mis un plus réaliste de l'exemple de mon fichier( je devrais peut-être mentionner que l'onglet est déterminé)

##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="# high-quality bases">
##FORMAT=<ID=SP,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled strand bias P-value">
##FORMAT=<ID=PL,Number=-1,Type=Integer,Description="List of Phred-scaled genotype likelihoods, number of values is (#ALT+1)*(#ALT+2)/2">
#CHROM  POS     ID      REF     ALT     QUAL    FILTER  INFO    FORMAT  rmdup_wl_25248.bam
Chr10   247     .       T       C       7.8     .       DP=37;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=7,1,19,0;MQ=15;FQ=6.38;PV4=0.3,1,0.038,1 GT:PL:GQ        0/1:37,0,34:36
Chr10   447     .       A       C       75      .       DP=30;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,22,5;MQ=14;FQ=-108 GT:PL:GQ        1/1:108,81,0:99
Chr10   449     .       G       C       35.2    .       DP=33;AF1=1;CI95=0.5,1;DP4=3,2,20,3;MQ=14;FQ=-44;PV4=0.21,1.7e-06,1,0.34        GT:PL:GQ        1/1:68,17,0:31
Chr10   517     .       G       A       222     .       DP=197;AF1=1;CI95=1,1;DP4=0,0,128,62;MQ=24;FQ=-282      GT:PL:GQ        1/1:255,255,0:99
Chr10   761     .       G       A       27      .       DP=185;AF1=0.5;CI95=0.5,0.5;DP4=24,71,8,54;MQ=20;FQ=30;PV4=0.07,8.4e-50,1,1     GT:PL:GQ        0/1:57,0,149:60
Chr10   1829    .       A       G       3.01    .       DP=74;AF1=0.4998;CI95=0.5,0.5;DP4=18,0,54,0;MQ=19;FQ=4.68;PV4=1,9.1e-12,0.003,1 GT:PL:GQ        0/1:30,0,45:28

Je dois dire que j'ai déjà ajouter hors ligne qui commence par # si c'est la commande que j'utilise:

awk '$1 !~/#/' | awk -F'\t' 'BEGIN{first=1;} {if (first) { max = min = $6; first = 0; next;} if (max < $6) max=$6; if (min > $6) min=$6; } END { print min, max }' wl_25210_filtered.vcf
awk '$1 !~/#/' | awk -F'\t' 'BEGIN{getline;min=max=$6} NF{ max=(max>$6)?max:$6 min=(min>$6)?$6:min} END{print min,max}' wl_25210_filtered.vcf

awk '$1 !~/#/' | awk -F'\t' '
NR==2{min=max=$6;next}
NR>2 && NF{
max=(max>$6)?max:$6
min=(min>$6)?$6:min
}
END{print min,max}' wl_25210_filtered.vcf

le problème est que j'ai étiquette sur le dessus de chaque colonne et quand je lance toutes les lignes que vous les gars ont donné. J'ai toujours l'étiquette imprimée
Voir ma réponse mis à jour et de publier un mieux la prochaine fois.
Vérifier mes mises à jour de réponse.
n'importe quel outil: stackoverflow.com/questions/9789806/...

OriginalL'auteur mahmood | 2011-12-22

awk linux

4

Vous pouvez créer deux fonctions définies par l'utilisateur et de les utiliser selon votre besoin. Cela vous donnera plus de solution générique.
```
[jaypal:~/Temp] cat file
a  212
b  323
c  23
d  45
e  54
f  102
[jaypal:~/Temp] awk '
function max(x){i=0;for(val in x){if(i<=x[val]){i=x[val];}}return i;}
function min(x){i=max(x);for(val in x){if(i>x[val]){i=x[val];}}return i;}
{a[$2]=$2;next}
END{minimum=min(a);maximum=max(a);print "Maximum = "maximum " and Minimum = "minimum}' file
Maximum = 323 and Minimum = 23
```
Dans la solution ci-dessus, il y a 2 fonctions définies par l'utilisateur - max et min. Nous stockons la colonne 2 dans un tableau. Vous pouvez stocker chacun de vos colonnes comme ceci. Dans le END déclaration, vous pouvez appeler la fonction et de stocker la valeur dans une variable et de l'imprimer.

Espérons que cette aide!

Mise à jour:

Exécuté la suite comme par exemple le plus récent -
```
[jaypal:~/Temp] awk '
function max(x){i=0;for(val in x){if(i<=x[val]){i=x[val];}}return i;}
function min(x){i=max(x);for(val in x){if(i>x[val]){i=x[val];}}return i;}
/^#/{next}
{a[$6]=$6;next}
END{minimum=min(a);maximum=max(a);print "Maximum = "maximum " and Minimum = "minimum}' sample
Maximum = 222 and Minimum = 3.01
```
c'est la réponse que je reçois quand je le lance pour mon dossier pour la colonne 6 Maximum = QUAL et Minimum =
de sorte que les colonnes qui voulez-vous max amd min? Votre question n'est pas de le mentionner.

OriginalL'auteur jaypal singh
6

Si votre fichier contient des lignes vides, ni des solutions fonctionnent.
Pour la manipulation correcte des lignes vides essayez ceci:
```
$ cat f.awk
BEGIN{getline;min=max=$6}
NF{
max=(max>$6)?max:$6
min=(min>$6)?$6:min
}
END{print min,max} 
```
Puis exécutez cette commande:
```
sed "/^#/d" my_file | awk -f f.awk
```
Au premier abord, il attrape la première ligne du fichier pour définir min et max.
Que pour chaque ligne non vide il utiliser l'opérateur ternaire vérifier,
si un nouveau min ou max a été trouvé. À la fin, le résultat de l'ist imprimé.

HTH Chris

le problème est que j'ai étiquette sur le dessus de chaque colonne et quand je lance toutes les lignes que vous les gars ont donné. J'ai toujours l'étiquette imprimée

OriginalL'auteur Chris

awk 'BEGIN {max = 0} {if ($6>max) max=$6} END {print max}' yourfile.txt

OriginalL'auteur lel7lel7

1
```
awk 'BEGIN{first=1;} 
{if (first) { max = min = $2; first = 0; next;}
if (max < $2) max=$2; if (min > $2) min=$2; }
END { print min, max }' file
```
C'est plus awk-ish: awk 'NR==1 {min=$2; max=$2; next} max < $2 {max=$2} min > $2 {min=$2} END {print min, max}' file
le problème est que j'ai étiquette sur le dessus de chaque colonne et quand je lance toutes les lignes que vous les gars ont donné. J'ai toujours l'étiquette imprimée

OriginalL'auteur codaddict
1

Utiliser le BEGIN et END blocs d'initialiser et d'imprimer des variables de garder une trace de la min et max.

par exemple,
```
awk 'BEGIN{max=0;min=512} { if (max < $1){ max = $1 }; if(min > $1){ min = $1 } } END{ print max, min}'
```
Votre min serait incorrect si tous les nombres sont négatifs et votre max serait incorrect si tous les chiffres ont été supérieure à 512.
voir cet article sur ce que les "ex" signifie: secure.wikimedia.org/wikipedia/en/wiki/E.g.#exempli_gratia je pense qu'il est sûr de laisser les op de prendre la décision sur l'a priori de ses données.
print min max sortie 23323 - vous besoin d'une virgule.
le problème est que j'ai étiquette sur le dessus de chaque colonne et quand je lance toutes les lignes que vous les gars ont donné. J'ai toujours l'étiquette imprimée
Cela a fonctionné pour moi... ces hypothèses sont correctes pour mes données 🙂

OriginalL'auteur Christopher Neylan

Min peut être trouvé par:

awk 'BEGIN {min=1000000; max=0;}; { if($2<min && $2 != "") min = $2; if($2>max && $2 != "") max = $2; } END {print min, max}' file

Ce sera de sortie le minimum et le maximum, séparés par des virgules

OriginalL'auteur kakoma

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