Visualisation de GraphML graphique?

Quelles sont les meilleures options pour visualiser un graphique définie dans GraphML sur Mac OSX ou Linux ? R + iGraph semble être une solution valable selon gremlin-groupe d'utilisateurs mais je me demandais si il existe une solution plus facile, idéalement, d'un simple "graphml2png" application en ligne de commande. Une idée ?

InformationsquelleAutor Jerome Serrano | 2014-02-10
  1. 8

    - Je utiliser affichent pas et il fonctionne sur Linux, Windows et OSX.
    De Plus il peut exporter vers de nombreux formats tels que PDF, PNG, SVG, BMP, etc

    Malheureusement, pas de ligne de commande de soutien autant que je sache

    • Bon! il semble un peu buggé comme il ne sera pas montrer certaines choses lorsque l'on clique sur eux, d'autres fois après quelques tentatives. Le principal conseil est de "se concentrer nœud", au "quartier" ou "prédécesseurs" droit et cliquez sur "convertir un document", qui va nous permettre de zoomer pour analyser plus en détail. thx!
    InformationsquelleAutor Massimo Callegari
  2. 7

    Je n'ai pas de recette, mais je peux partager mes pensées sur elle.

    Depuis le graphique peuvent être visualisées dans un grand nombre de moyens, vous devriez être en mesure de gérer son apparence en quelque sorte. Tout simplement le dessin des nœuds et des arêtes sans aucun pré-traitement n'est pas une bonne option - cette approche vous donnera un hasard tas de bords et des nœuds, en particulier sur les grands graphes.

    Voici un exemple d'algorithme pour obtenir un nettoyage et visuellement attrayants, la représentation d'un graphe:

    1. Exécuter une force dirigée de l'algorithme sur le graphe.
    2. Calculer le graphe de la modularité et de la couleur de chaque nœud par sa modularité en classe.
    3. Changer la taille de chaque nœud en fonction de son degré.
    4. Si le graphique est trop grand, filtrer les nœuds que vous n'êtes pas intéressé (probablement nœuds avec un faible degré).
    5. Modifier les bords de l'épaisseur en fonction de leur poids.
    6. Ajouter des étiquettes de nœuds et d'arêtes.

    Vous pouvez faire des trucs comme ça avec Gephi (en mode manuel). Ils offrent également un Gephi Toolkit qui devrait être en mesure d'automatiser, de telles choses (malheureusement, moi je ne l'ai pas essayé encore). Alors j'aimerais essayer d'écrit console simple programme Java qui utilise cette boîte à outils.

    Voici un exemple de graphique visualisée à l'aide de l'algorithme ci-dessus:

    Visualisation de GraphML graphique?

    • nous n'avons aucune solution pour les applications web? Je veux faire un Angulaires Application pour visualiser avec soit D3.js ou Cytoscpae mais tous les travaux avec CSV ou JSON, connaissez-vous une bibliothèque qui convertit GraphML en JSON ou CSV ?
    InformationsquelleAutor Sergey Kolodiy